益气活血法对大鼠萎缩性胃炎癌前病变差异基因表达谱的影响

表1 Real-time PCR反应条件

反应步骤	t(℃)		t(S)	循环	荧光信号收集
预孵育		95	120	1	无
		95	20
扩增		58	25	45	在延伸阶段结束时
		72	30
溶解		65	0	1	在温度缓慢升高过程中
曲线		95	20

表2 样品RNA浓度 (g/L)

分组	样品编号	总RNA浓度	纯化后RNA浓度
益气活血组	1	1.88	1.78
	2	2.94	1.33
	3	2.65	1.50
空白对照组	10	3.36	1.26
	11	3.36	1.40
	12	3.26	1.63
自然恢复组	13	2.56	1.24

表3 三张芯片差异基因数目

芯片编号	55006	55007	55008
上调基因数	566	346	452
下调基因数	706	640	519

表4 益气活血组筛选出的部分差异表达基因列表

上调基因				下调基因
GenBank	RATIO1	RATIO2	RATIO3	GenBank	RATIO1	RATIO2	RATIO3
NM_012564	99.01	44.64	42.37	NM_031821	0.25	0.25	0.32
NM_012657	44.25	38.61	41.84	BI296915	0.23	0.32	0.29
NM_145779	34.25	21.14	25.06	XM_149281	0.23	0.23	0.39
NM_012898	25.00	23.92	22.47	NM_133404	0.23	0.27	0.49
NM_134326	24.15	19.57	21.10	BE095796	0.22	0.32	0.27
NM_012582	22.17	15.43	14.16	NM_031320	0.21	0.32	0.24
NM_013112	19.65	8.77	15.90	BC017596	0.21	0.15	0.30
NM_031531	19.61	8.40	11.72	XM_134666	0.21	0.29	0.12
NM_019156	19.46	8.20	10.13	NM_012552	0.21	0.23	0.18
NM_012901	17.83	8.13	7.87	BF396698	0.20	0.28	0.29
NM_053469	17.70	6.85	2.29	AI144892	0.20	0.18	0.21
NM_019184	16.03	9.90	11.55	BF544595	0.20	0.34	0.07
BQ191104	13.28	7.14	10.44	NM_012623	0.19	0.17	0.11
NM_080576	13.18	6.41	6.90	BE118680	0.19	0.14	0.22
XM_342639	12.71	8.06	8.13	M92076	0.18	0.15	0.22
NM_017233	12.38	5.56	6.99	NM_023970	0.17	0.15	0.17
NM_053768	12.02	7.35	13.00	XM_041991	0.17	0.31	0.28
BQ191104	11.86	6.29	10.28	BE099720	0.14	0.33	0.22
NM_017055	11.81	5.18	7.19	NM_012847	0.14	0.19	0.13
NM_031971	10.36	11.43	2.75	NM_013034	0.10	0.18	0.36
NM_031543	10.24	8.47	8.93	NM_152936	0.08	0.06	0.36
NM_020071	10.08	8.26	6.54	NM_016997	0.08	0.07	0.19
NM_017024	9.62	4.26	6.80	NM_016997	0.08	0.06	0.13
NM_175837	8.55	2.93	5.92	NM_012635	0.05	0.06	0.13
NM_030832	8.40	4.29	7.46	NM_012553	0.04	0.06	0.09
NM_053288	8.26	5.18	4.03	NM_139086	0.02	0.02	0.06
NM_053617	8.26	4.88	7.04	NM_173127	0.02	0.02	0.04
NM_030850	8.20	3.89	7.25	NM_054009	0.02	0.02	0.04
XM_129207	8.20	3.33	2.42	NM_031502	0.02	0.02	0.03
NM_057146	7.81	8.70	6.85	NM_013161	0.01	0.02	0.02

表5 GO分析结果与凋亡相关的4个基因

GeneBank ID	gene title
NM_031971	heat shock 70 kd protein 1a
AI599423	growth arrest and dna-damage-inducible
NM_057146	complement component 9
NM_134326	albumin

表6 正常对照组与凋亡相关的4个基因的RATIO值

GenBank	RATIO1(10744)	RATIO2(10745)	RATIO3(18748)
NM_031971	0.92	1.08	0.98
AI599423	1.00	0.94	0.81
NM_057146	0.64	0.61	-
NM_134326	1.13	0.96	0.89

表7 HSP70基因表达Real-time PCR验证

编号	actin	平均值	HSP70	平均值	ΔCT	2-ΔCT
1	19.04	19	22.79	22.71	3.71	0.76
1	18.96		22.63
2	18.83	19.1	23.05	22.73	3.63	0.81
2	19.37		22.40
3	20.97	21.015	24.93	24.90	3.88	0.68
3	21.06		24.86
13	24.52	24.41	28.89	28.86	4.45	0.46
13	24.30		28.83