采用基因芯片技术筛选黑斑息肉综合征相关基因

表1 基因差异表达结果

差异表达基因	腺瘤特异性变化	PJS息肉特异性变化	两者相似的变化
总数	432	270	141
上调	93	166	31
下调	339	104	110

表2 PJS部分特异差异表达基因

GenBank	Function	Tag	腺瘤	PJS息肉
AI261660	EphB4	EPHB4	1.01	0.48
AA456088	EphB3	EPHB3	0.93	0.40
R48320
AI732309	EphB1	EPHB1	0.88	0.38
AA461108	ephrin-B2	EFNB2	1.49	0.38
AA857015	ephrin-A1	EFNA1	0.75	0.48
	collagen,
	type
AA150402	IV, alpha 1	COL4A1	0.95	2.37
	collagen,
	type
AA430540	IV, alpha 2	COL4A2	0.82	2.61
	collagen,
	type
R62603	VI, alpha 3	COL6A3	0.92	2.86
	collagen,
	type
AA633747	VI, alpha 2	COL6A2	0.87	2.38

表3 芯片实验结果与RT-PCR实验结果

基因	Tag	腺瘤/对照		息肉/对照
		芯片数据	RT-PCR数据	芯片数据	RT-PCR数据
Keratin 8	KRT8	0.12	0.11	0.26	0.56
Cyclin-dependent kinase inhibitor 1A(p21, Cip1)	CDKN1A	0.37	0.27	0.68	0.64
V-myc avian myelocytomatosis viral oncogene homolog	MYC	2.85	1.73	1.09	1.11
Mitogen-activated protein kinase 1	MAPK1	0.20	0.90	0.27	0.02
Collagen, type VI, alpha 3	COL6A3	0.92	0.75	2.86	3.45