基因芯片技术检测西藏拉萨地区的乙型肝炎病毒基因型

表1 PCR引物和HBV DNA基因分型探针序列

引物/探针		位置	序列组成
引物	上游外引物	182-202 nt	5′TAG GAC CCC TGC TCG TGT TAC
	下游外引物	805-824 nt	5′CA(A/G) AGA CAA AAG AAA ATT GG
	上游内引物	246-266 nt	5′GAG TCT AGA CTC GTG GTG GAC
	下游内引物	777-797 nt	5′GG(T/C) A(T/A)A AAG GGA CTC A(A/C)G ATG
探针	通用探针A-G1	377-393 nt	5′GG ATG TGT CTG CGG CGT
	通用探针A-G2	393-377 nt	5′ACG CCG CAG ACA CAT CC
	A1	483-502 nt	5′A ATT CCA GGA TCA ACA ACA A
	A2	502-483 nt	5′T TGT TGT TGA TCC TGG AAT T
	BE1	483-502 nt	5′A ATT CCA GGA TCA TCA AC(C/A) A
	BE2	502-483 nt	5′T (G/T)GT TGA TGA TCC TGG AAT T
	C1	483-502 nt	5′A CTT CCA GGA ACA TCA ACT A
	C2	502-483 nt	5′T AGT TGA TGT TCC TGG AAG T
	ABDFG1	596-613 nt	5′GCA CCT GTA TTC CCA TCC
	ABDFG2	613-596 nt	5′GGA TGG GAA TAC AGG TGC
	CEF1	596-613 nt	5′GCA CTT GTA TTC CCA TCC
	CEF2	613-596 nt	5′GGA TGG GAA TAC AAG TGC
	A3	483-502 nt	5′A ATT CCA GGA TCC ACA ACA A
	C3	524-540 nt	5′CC TGC ACG ATT CCT GCT
	C4	540-524 nt	5′AGC AGG AAT CGT GCA GG
	D1	549-566 nt	5′C TCT ATG TAT CCC TCC TG
	D2	284-300 nt	5′GG GGA ACC ACC GTG TGT
	D3	284-300 nt	5′GG GGA ACT ACC GTG TGT
	E1	613-630 nt	5′CCA TCA TCA TGG GCT TTC
	E2	700-716 nt	5′TGG TTC GCC GGG CTT TC
	F1	680-699 nt	5′TA CTA GTG CAA TTT GTT CAG
	F2	699-680 nt	5′CTG AAC AAA TTG CAC TAG TA
	G1	483-500 nt	5′G ATT CCA GGA TCC TCG AC

所列的核苷酸序列位置均为BioEdit比对后的位置, 比对时因出现空位等造成与GenBank中的位置有少许差异.

表2 92例血清标本的PCR扩增结果(n)

分组	n	≥1.0X103/阳性	<1.0X103/阳性
HBsAg、HBeAg和抗-HBcAb阳性	32	32(7.33±1.12)/32	0/0
HBsAg、抗-HBeAb和抗-HBcAb阳性	46	11(5.06±1.18)/11	35(1.11±0.98)/19
HBsAg和抗-HBcAb阳性	14	9(5.72±1.17)/9	5(1.40±1.14)/2
合计	92	52/52	40/21

括号内为DNA拷贝数的对数值.

表3 基因型的详细分布

分组	n	B	C	D	B/D	P值
乙肝标志物
HBsAg、HBeAg和抗-HBcAb阳性	32	7	6	19	0
HBsAg、抗-HBeAb和抗-HBcAb阳性	30	4	9	14	3
HBsAg和抗-HBcAb阳性	11	2	3	6	0	0.778
荧光定量PCR
≥1.0×103拷贝/mL	52	11	10	28	3
<1.0×103拷贝/mL	21	2	8	11	0	0.205
性别
男性	38	6	8	21	3
女性	35	7	10	18	0	0.767
民族
汉族	28	9	6	11	2
藏族	45	4	12	28	1	0.028