修回日期: 2017-05-24
接受日期: 2017-06-02
在线出版日期: 2017-09-08
结直肠癌是常见的消化系恶性肿瘤之一, 其发生和发展是一个涉及多因素、多步骤的复杂过程. 长链非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNA)是一类长度大于200个核苷酸, 缺乏开放阅读框, 无蛋白质编码功能的RNA. 通过诱饵分子、信号分子、支架分子、引导分子等4种形式在转录、转录后和表观遗传学多个水平调控基因的表达, 参与了多种疾病的发生发展. 同时, LncRNA在结直肠癌的临床应用中也有重大价值, 参与结直肠癌的诊断、预防、治疗与预后. 本文就近年来人们对于LncRNA与结直肠癌关系的研究进展作一综述, 并探讨通过LncRNA治疗结直肠癌的现状和前景.
核心提要: 本文综述了已经过实验研究证实的与结直肠癌有关的重要长链非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNA), 介绍了多种LncRNA在结直肠癌的发生发展、转移侵袭、早期诊断、预后评价、放化疗疗效等方面的重要作用.
引文著录: 李佳茜, 孙青. 长链非编码RNA在结直肠癌中的作用及临床价值. 世界华人消化杂志 2017; 25(25): 2261-2267
Revised: May 24, 2017
Accepted: June 2, 2017
Published online: September 8, 2017
Colorectal cancer is one of the common malignant tumors of the digestive tract. The occurrence and development of colorectal cancer are a complicated multi-factorial and multi-step process. Long non-coding RNAs (lncRNAs) are a class of non-protein coding transcripts with a length longer than 200 nucleotides. LncRNAs have been demonstrated to be involved in the development of multiple diseases by acting as bait, signal, scaffold, or leader molecules to regulate the expression of multiple genes at the transcriptional or epigenetic levels. LncRNAs are also of great clinical value in colorectal cancer, and can be used for the diagnosis, prevention, treatment, and prognosis evaluation of colorectal cancer. In this paper, we review the progress in research of lncRNAs in colorectal cancer and discuss their current and potential applications in this malignancy.
- Citation: Li JX, Sun Q. Long non-coding RNAs in colorectal cancer: Role and clinical value. Shijie Huaren Xiaohua Zazhi 2017; 25(25): 2261-2267
- URL: https://www.wjgnet.com/1009-3079/full/v25/i25/2261.htm
- DOI: https://dx.doi.org/10.11569/wcjd.v25.i25.2261
近年来, 随着人们生活方式的改变, 生活水平的提高, 以及中国老龄化社会的到来, 中国结直肠癌发病率和死亡率呈逐年上升趋势. 2012年结直肠癌全球新发病例约为136.06万, 居恶性肿瘤第3位; 死亡病例约为69.39万, 居恶性肿瘤第4位[1]. 因此寻找早期有效诊断和治疗结直肠癌的标志物迫在眉睫. 随着对长链非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNA)研究的不断深入, LncRNA的生物学功能, 在肿瘤细胞生物学行为中的作用, 以及在肿瘤诊断和治疗的潜在价值也逐渐引起人们的注意, 希望通过对LncRNA的研究找到针对结直肠癌诊断和治疗的新思路.
目前公认, LncRNA是指长度大于200个核苷酸, 广泛存在于细胞核和细胞质内, 不能编码蛋白质但具有基因表达调节功能的一类RNA[2], 在人类基因组中占至少90%的转录序列. 根据LncRNA与蛋白质编码基因的位置关系, 可分为正义、反义、双向、基因内、基因间5种类型[3]. 而根据其分子机制, 又可以分为信号分子、诱饵分子、引导分子和支架分子[4]. LncRNA具有数量多、类型多和作用模式多等特点, 他们的表达具有时空特异性和组织特异性[5], 广泛参与机体众多生理、病理过程.
LncRNA在转录调控、转录后调控及表观遗传学调控层面发挥着重要的作用. 他们的生物学功能包括: 染色体修饰、X染色体沉默、DNA甲基化、干扰核内运输、转录激活或沉默等[4-6]. 主要作用方式为: (1)通过与mRNA形成互补链干扰mRNA的剪切[7]; (2)直接与蛋白质结合调节其活性或改变其细胞质定位[8]; (3)通过抑制RNA聚合酶影响下游基因表达[9]; (4)通过介导染色质重构及组蛋白修饰影响下游基因表达[9]; (5)作为竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA, ceRNA)参与调控基因表达[10]; (6)通过在蛋白编码基因上游启动子区发生转录干扰下游基因的表达[11]. 总之, LncRNA可以通过复杂的机制来调节基因、甚至整条染色体的表达, 越来越多的研究表明LncRNA的异常表达在致癌和抑癌中具有举足轻重的作用.
研究发现, 一些LncRNA通过上调或下调的异常表达来影响细胞周期、抑制细胞凋亡、促进肿瘤细胞增殖、侵袭、转移, 从而影响了肿瘤的进程.
2.1.1 母源性印记基因19转录因子: 母源性印记基因19转录因子(imprinted maternally expressed transcript, H19)基因位于人类染色体11P15.5, 长度约为2300 nt, 主要分布于细胞质内, 是一个高度保守的具有印记特征的基因, 通过反式调节印记基因网络调节细胞生长, 其高表达已被证实有促癌作用[12]. Han等[13]研究发现, H19可以通过结合eIF4A3-一个通过mRNA前剪接装载到mRNA上的核心外显子连接组分, 来加速细胞周期进程, 从而促进结直肠癌细胞的增殖.
2.1.2 结直肠癌差异表达基因-h: 结直肠癌差异表达基因-h(colorectal neoplasia differentially expressed-h, CRNDE-h)定位于人类染色体16q12.2, 长度为1059 nt[14]. 2011年, Graham等[15]研究发现CRNDE-h在结直肠癌肿瘤组织中表达上调. Ellis等[16]进一步研究证实, CRNDE是PI3K/Akt/mTOR和Raf/MAPK通路的下游目的基因, 其包含一段高度保守的转录序列-gVC-In4, 并通过胰岛素/胰岛素样生长因子发生作用, 从而使得CRNDE在结直肠癌中高表达. IRX5 mRNA是由CRNDE邻近的蛋白质编码基因IRX5编码的, 已被证实可以通过调节细胞凋亡来促进肿瘤的发生、发展. Liu等[14]通过斯皮尔曼相关分析142例结直肠癌组织中LncRNA CRNDE-h和IRX5 mRNA的表达水平, 证实CRNDE-h的表达与IRX5 mRNA的表达呈显著正相关, 从而在结直肠癌中起到致癌基因的作用. 但是, Liu等[14]并没有清楚地证明CRNDE-h在肿瘤发生中的分子功能, 仍需进一步探索研究.
2.1.3 胃腺癌预测长链非编码RNA: 胃腺癌预测长链非编码RNA(gastric adenocarcinoma predictive long intergenic noncoding RNA, GAPLINC)是一条长度为924 bp的长链非编码RNA. Yang等[17]通过原位杂交分析已证实, 高表达的GAPLINC可以增大结直肠癌患者肿瘤体积, 提高T、N分期, 提高死亡率, 减少结直肠癌患者生存时间; 同时, 通过体内及体外实验表明, GAPLINC低表达可以抑制结直肠肿瘤细胞增殖和侵袭. 进一步研究发现, GAPLINC通过结合PSF蛋白和NONO蛋白来提高SNAI2的表达, 从而可以促进结直肠癌肿瘤细胞的侵袭. CD44是一种在多种生物学过程中发挥重要作用的细胞表面跨膜糖蛋白[18], 同时也是多种实体肿瘤的干细胞标志物, 可以促进肿瘤的发生和进展[19]. Wu等[20]研究发现, GAPLINC可以通过竞争miR211-3p来上调CD44的表达, 进而促进结直肠癌肿瘤细胞的增殖.
2.2.1 母系印记表达基因3: 母系印记表达基因3(maternally expressed gene 3, MEG3)定位于染色体14q32, 长度约为1700 bp. MEG3在许多正常细胞中表达, 尤其在脑和脑垂体呈高表达, 但在许多原发性肿瘤中表达下调乃至缺失[21,22]. 朱栋良等[23]研究发现, 结直肠癌细胞中MEG3的表达明显降低, 在结直肠癌中过表达MEG3可以抑制细胞的侵袭、迁移能力, 同时发现表达MEG3可以显著抑制MMP-2及MMP-9的表达, 而上调TIMP-2的表达, 从而为MEG3调控结直肠癌细胞的侵袭迁移提供了可能的理论依据. Sheng等[24]发现, MEG3可作为转录协同活化因子激活p53的表达, 同时, 还可以与MDM2或p53形成复合物, 阻断p53的降解, 从而产生抑癌效应. Yin等[25]通过对62例结直肠肿瘤组织及相应癌旁组织的研究发现, 结直肠癌患者组织中MEG3表达下降, 并且与组织学分级、肿瘤浸润深度、TNM分期有明显联系. 进一步体内及体外实验显示, MEG3表达量升高可以有效地抑制结直肠癌肿瘤细胞增殖. 这为结直肠癌的治疗提供了一个新的分子靶点.
2.2.2 生长阻滞特异性转录子5: 生长阻滞特异性转录子5(growth arrest-specific transcript 5, GAS5)定位于人类染色体1q25.1, 全长630 nt[26]. 近年来研究表明, GAS5在多种肿瘤组织中呈低表达, 表现为抑癌基因的作用. GAS5可以与DNA糖皮质激素受体元件竞争结合糖皮质激素受体的DNA结合域, 从而发挥诱饵分子的作用. 2014年, Yin等[27]以66例结直肠癌患者肿瘤组织和相邻正常组织作为标本进行研究, 首先通过qRT-PCR发现GAS5在癌组织中表达量明显低于癌旁正常组织, 并且当肿瘤组织体积越大、组织学分级越低、TNM分期越高时, GAS5表达水平越低. 进一步的体内及体外实验中, 对结直肠癌细胞过表达GAS5后, 其生长均受到抑制. 上述实验表明, GAS5表达下调在结直肠癌发生、发展中起着重要作用.
2.2.3 ncRuPAR: ncRuPAR是新检测出的一条LncRNA. 研究[28]发现, 高表达的蛋白酶活化受体-1(protease-activated receptor-1, PAR-1)可以促进肿瘤生长、侵袭和转移. 在高侵袭性乳腺癌[29]、结肠癌[30]和晚期前列腺癌[31]中已检测出了PAR-1的过度表达. Liu等[32]已证实ncRuPAR的潜在机制可以抑制PAR-1的表达从而抑制胃癌的进展. Yan等[33]用qRT-PCR检测了105例结直肠癌患者肿瘤组织及其相邻正常组织中ncRuPAR和PAR-1的表达量, 发现肿瘤组织中ncRuPAR表达量较相邻正常组织明显下降, 但是PAR-1的表达量较正常组织明显升高. 这提示ncRuPAR可能通过下调PAR-1的表达来抑制结直肠癌进程, 但仍需进一步实验证明.
随着近年来对LncRNA研究的深入, 越来越多在结直肠癌中异常表达的LncRNA被发现: 高表达的MALAT1可以通过促进结直肠癌细胞增殖、侵袭和转移, 抑制肿瘤细胞凋亡来发挥促癌作用[34]; PVT1的上调能够促进结直肠癌细胞的增殖能力[35]; Zhou等[36]研究发现, GHET1在结直肠癌患者组织中高表达, 并可以通过促进上皮细胞间质转化来促进结直肠癌细胞增殖和转移; CCTA2能够提高肿瘤细胞染色体不稳定性, 其表达升高可以促进结直肠癌肿瘤细胞的增殖和转移[37]; 同源基因的转录反义RNA(HOX transcript antisense RNA, HOTAIR)是一个具有反式调控作用的LncRNA, 其上调可以通过PRC2复合物的募集从而进行染色质修饰并沉默多个靶基因的表达, 激活癌细胞侵袭和转移, 促进结直肠癌的发生、发展[38]; ANRIL已被证实在结直肠癌中表达量升高, 可以通过p15/p16-pRb通路正调节结直肠癌细胞增殖[39], ANRIL上调与TNM分期、Duke分期及淋巴转移相关; Guo等[40]研究发现, BANCR在结直肠癌中高表达, 与淋巴结转移和肿瘤分期有关, 可以通过MEK/细胞外信号调节激酶依赖性机制引起上皮细胞间质转化, 从而诱导增强细胞凋亡; TUG1在结直肠癌中呈高表达状态, 通过激活上皮间质转化相关基因的表达促进结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭[41].
近年来研究表明, LncRNA在肿瘤组织中的异常表达, 大大提高了LncRNA作为肿瘤标志物在临床诊断中的可能性. Nissan等[42]发现, 结直肠癌患者组织中结肠癌相关转录因子1(colon cancer associated transcript 1, CCAT1)的表达量比正常肠黏膜组织平均高235倍; 同时, CCAT1在早期肿瘤组织及晚期肿瘤组织中均呈高表达状态, 并且在40%的结直肠癌患者外周血中表达上调. 提示CCAT1的异常表达与结直肠癌显著相关, 并且贯穿结直肠癌发生、发展的整个过程, 包括: 腺瘤性息肉、结直肠癌、结直肠癌淋巴转移及肝转移. 显然, CCAT1在结直肠癌的诊断中具有潜在优势.
此外, 还有多种LncRNA也具有诊断价值. Yan等[33]通过分析105例结直肠癌患者肿瘤组织及其相邻正常组织中ncRuPAR表达量的ROC曲线发现, 组织中的ncRuPAR的表达量可以区分结直肠癌患者与健康者, 其灵敏度为97.14%, 特异度为65.87%, 预测结直肠癌的精确度为82.86%. Graham等[15]发现, 血浆中CRNDE-h表达量区分结直肠癌患者和健康者的灵敏度为87%, 特异度为93%. 结直肠癌患者肿瘤组织中HOTAIR表达灵敏度为76%, 特异度为92.5%[43].
放疗、化疗是临床治疗结直肠癌的重要手段之一, 因此, 许多研究人员对于LncRNA与结直肠癌患者放化疗的关系也进行了深入研究. Yang等[44]等研究发现, 下调HOTAIR不但可以抑制肿瘤增殖和侵袭, 还能够提高结直肠癌放疗敏感性. Wang等[45]发现, LncRNA-P21在结直肠癌组织及细胞系中表达下降, 并且可以通过抑制wnt/β-catenin信号通路来促进细胞凋亡, 从而提高结直肠癌对放疗的敏感性. Ma等[46]研究发现, 结直肠癌患者中, CCAL表达量低者比CCAL表达量高者对辅助化疗更为敏感. 众所周知, 肿瘤化疗失败的主要原因是肿瘤细胞耐药性的产生, 近期有研究[47,48]发现, LncRNA AK126698和UCA1都可以通过wnt通路来调控不同癌细胞的顺铂耐药性. GAS5上调已被证实可以增强细胞对化疗药物的敏感性[27]. 这些研究都为结直肠癌的放疗和化疗提供了潜在的靶点.
随着研究的深入, 研究人员发现多种LncRNA的异常表达与结直肠癌患者临床预后有着密切关系. 一些LncRNA可以作为结直肠癌患者总生存率的独立预后指标, 如H19[13]、CRNDE-h[14]、MEG3[25]、PCAT-1[49]. 众所周知, 转移是影响结直肠癌患者预后的一个重要因素, 许多LncRNA表达水平已被证实与结直肠癌的转移有关, 如ncRuPAR[33]、91H[50]、PCAT-1[49]、HOTAIR[38]、 MALAT1[34]. Wu等[38]研究发现, HOTAIR在结直肠癌组织中的上调能显著提高结直肠癌细胞的侵袭能力, 并且与结直肠癌侵犯深度、淋巴结转移及远处转移呈正相关, 使患者复发率增加, 所以HOTAIR可以评定结直肠癌恶性程度和预后复发. Yang等[34]研究发现, MALAT1的高表达可以促进结直肠癌细胞的增殖和转移, 患者总生存率显著缩短, 与不良预后密切相关.
近年来, 随着结直肠癌发病率的日益升高以及对于LncRNA研究的日渐深入, LncRNA与结直肠癌的关系越来越引起研究人员的注意. 越来越多在结直肠癌中异常表达的LncRNA被人们发现, 但其作用机制还不清楚, 在临床应用也存在许多问题. 比如: (1)研究主要集中在结直肠癌肿瘤组织中LncRNA的表达水平, 对于外周血、尿液以及唾液中的LncRNA的研究少见; (2)对于LncRNA的研究绝大多数是在动物水平、组织水平以及细胞水平上的研究, 缺乏大规模、大样品的循证医学数据支持. 不久的将来, 研究人员将会针对这些问题进行研究, 而LncRNA将会为结直肠癌的诊断、预防、治疗以及预后开辟一条新的途径.
随着分子生物学技术的发展, 结直肠癌相关长链非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNA)相继被发现, 均不同程度地影响肿瘤的发生发展、转移侵袭及预后. 他们很可能成为结直肠癌新型的诊断和预后标志物.
各种LncRNA在结直肠癌发生发展中有无协同作用, 怎样将LncRNA应用于临床是该领域亟待研究的问题.
本文系统介绍了多种LncRNA在结直肠癌的发生发展、转移侵袭、早期诊断、预后评价、放化疗疗效等方面的重要作用.
本文提到的多种LncRNA可以作为结直肠癌的早期诊断指标以及预后指标, 以相关LncRNA为药物靶点的新药研发可能给结直肠癌患者的治疗带来新希望.
陈绍勤, 副教授, 主任医师, 福建医科大学附属第一医院胃肠外科二病区; 马大烈, 教授, 主任医师, 长海医院病理科; 赵春玲, 副教授, 潍坊医学院细胞生物学教研室
本文较为系统地综述了几种与结直肠癌相关的LncRNA, 撰写比较规范.
手稿来源: 邀请约稿
学科分类: 胃肠病学和肝病学
手稿来源地: 山东省
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编辑:闫晋利 电编:李瑞芳
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