修回日期: 2017-07-05
接受日期: 2017-07-11
在线出版日期: 2017-08-18
初步探讨新疆维汉民族溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)患者及正常对照人群中白介素23受体(interleukin-23 receptor, IL-23R)基因中9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点的基因型, 以探究IL-23R基因的UC易感位点.
采用SNaPshot SNP分型技术对263个样本进行9个SNP位点基因分型, 分析上述位点基因型, 对比维汉民族、维吾尔族UC组与对照组, 汉族UC组与对照组上述位点基因型频率、等位基因频率, 探索IL-23R基因的UC易感位点及其在维汉民族间有无差异.
与维吾尔族对照组相比, 维吾尔族UC组在rs11805303、rs17375018基因型上差异有统计学意义(P<0.05). 与汉族对照组相比, 汉族UC组在rs1495965、rs11805303、rs17375018基因型上差异有统计学意义(P<0.05). 维吾尔族UC组与汉族UC组在上述9个SNP位点的基因型差异无统计学意义(P>0.05).
IL-23R基因的rs1495965、rs11805303、rs17375018可能是影响UC发病的易感位点, 但本研究涉及IL-23R基因9个SNP位点基因型在维汉民族间无明显差异, 考虑上述位点可能不是民族易感性位点.
核心提要: 本研究初步探讨新疆维汉民族溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)患者及正常对照人群中白介素23受体(interleukin-23 receptor, IL-23R)基因中9个单核苷酸多态性位点的基因型, 以探究IL-23R基因的UC易感位点及民族易感性位点.
引文著录: 崔旻, 谭芳, 王海昆, 姚萍, 谭庆华. 新疆维吾尔族和汉族溃疡性结肠炎患者IL-23R基因多态性的初步研究. 世界华人消化杂志 2017; 25(23): 2109-2116
Revised: July 5, 2017
Accepted: July 11, 2017
Published online: August 18, 2017
To genotype nine single nucleotide polymorphism (SNP) loci of the IL-23R gene in Uygur and Han patients with ulcerative colitis (UC) to identify the loci associated with susceptibility to UC.
The SNaPshot SNPS genotyping technology was used to assay nine SNP loci of the IL-23R gene in 263 samples. The genotype frequency and allele frequency of the above loci were compared between Han UC patients and Uygur UC patients, between Uygur UC patients and normal controls, and between Han UC patients and normal controls to identify the loci associated with susceptibility to UC. The possible differences in the loci associated with susceptibility to UC between Uygur and Han populations were also explored.
The genotypes of rs11805303 and rs17375018 loci differed significantly between the Uygur UC group and the control group (P < 0.05). The genotypes of rs1495965, rs11805303 and rs17375018 loci differed significantly between the Han UC group and the control group (P < 0.05). The genotypes of the nine SNP loci showed no differences between the Uygur UC group and the Han UC group (P > 0.05).
The rs1495965, rs11805303 and rs17375018 loci of the IL-23R gene may be associated with susceptibility to UC. The nine SNPs studied show no difference between the Uygur UC group and the Han UC group.
- Citation: Cui M, Tan F, Wang HK, Yao P, Tan QH. Gene polymorphisms of interleukin-23 receptor in Uygur and Han Chinese patients with ulcerative colitis. Shijie Huaren Xiaohua Zazhi 2017; 25(23): 2109-2116
- URL: https://www.wjgnet.com/1009-3079/full/v25/i23/2109.htm
- DOI: https://dx.doi.org/10.11569/wcjd.v25.i23.2109
溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)是一种慢性、非特异性的肠道炎症性疾病, 在我国的发病率约为11.6/10万, 呈逐年增高趋势[1,2]. UC的病因和发病机制尚不十分清楚, 国内外大量研究[3,4]认为UC的发病可能与遗传、免疫、环境、肠道菌群、精神及心理等多种因素的相互作用有关, 部分家族聚集性和双生子的研究[5]表明, UC有很强的基因易感性. 目前认为其是在一定的遗传背景下, 人体免疫系统对肠道微生物出现局部免疫高反应所致[6,7], 特定的遗传变异是炎症性肠病发病的一个直接原因. 其中白介素23受体(interleukin-23 receptor, IL-23R)在UC的发生发展中有着重要作用[8,9]. UC的发病存在一定的种族和地区差异, 这可能与患者居住的环境、卫生条件、生活水平、饮食习惯等相关. 新疆是一个多民族聚集地, 由于独特的地理环境、气候、饮食结构等特点, 使许多疾病的发病情况和临床特点表现出独特之处, 据相关调查显示新疆汉族与维吾尔族UC的发病情况及临床特点不同, 但导致这种差异的原因目前尚不清楚[10]. 通过查阅大量文献, 本研究选择维汉UC患者及健康对照组IL-23R基因中9个与UC发病密切相关的SNP位点(rs1004819、rs1495965、rs1884444、rs2201841、rs10489629、rs10889677、rs1343151、rs11805303、rs17375018)[11-17]进行研究, 以探讨IL-23R与UC易感性的关系及其是否在遗传基因方面存在民族差异性.
1.1.1 研究对象与分组: 收集2015-06/2016-10在新疆医科大学第一附属医院消化科住院的UC患者181例及正常对照组82例. UC的诊断采用2012年中华医学会消化病学分会炎症性肠病组《炎症性肠病诊断与治疗的共识意见》[18], 所有UC患者均接受肠镜检查并随访半年以上, 其中维吾尔族UC组92例, 汉族UC组89例, 所有UC患者排除合并肝肾功能不全者、结缔组织疾病、自身免疫疾病、肠梗阻、肠结核、阿米巴肠病、急性肠道感染、肿瘤患者及溃疡性结肠炎合并艰难梭菌、巨细胞病毒感染等. 同时选取正常对照组82例, 其中维吾尔族对照组45例, 汉族对照组37例, 均为健康体检者, 完善肠镜检查未发现肠道病变, 除外合并心肝肾功能不全者、结缔组织疾病、自身免疫疾病、肿瘤病变等. 该研究经新疆医科大学第一附属医院伦理审批通过(伦理号: 20140818-03), 所有样本的获取均获得研究对象的知情同意. 研究所用新试剂与分析工具由新疆医科大学第一附属医院科研平台提供.
1.1.2 主要试剂: HotStar HiFidelity Polymerase Kit(Qiagen), DL2,000 DNA Marker(上海捷瑞), SNaPshot® MuLtiplex Kit(ABI), GeneScanTM-120 GeneScan(ABI), Hi-Di™ Formamide(ABI), 外切酶Ⅰ(EXO-Ⅰ)、Taq酶、dNTP(Fermentas公司)等.
1.1.3 主要仪器: 漩涡混合器, 台式低速离心机, DK-8D型电热恒温水槽, Tanon-3500R凝胶成像仪, 紫外分析装置, 多用电泳仪电源, 立式压力蒸汽灭菌器, PCR仪, Thermal Cycler, 台式微量高速离心机, 3730xl genetic analyze, 离心机, 微量可调移液器, Nano-100核酸蛋白定量仪等.
1.2.1 基因组DNA提取: 采集所有研究对象清晨空腹静脉血2 mL, 冻存于-80 ℃冰箱, 待所有样本收集后统一置于37 ℃恒温溶解用来提取DNA, 在进行提取前彻底混匀后备用, 提取血液基因组DNA, 核酸蛋白定量仪检测DNA浓度(A260/280为1.6-1.9), 琼脂糖凝胶电泳检测DNA完整性.
1.2.2 多重PCR反应: 加入引物, 引物采用在线Primer3软件设计, 乌鲁木齐易欧生物医学科技有限公司设计提供(表1)、10* buffer、ddH2O、DNTP进行Touch-down反应(反应条件: 前11个循环, 每循环温度减少0.5 ℃, 退火温度60 ℃, 延伸温度72 ℃; 后24个循环, 退火温度54 ℃, 延伸温度72 ℃), 后行PCR产物纯化(37 ℃ 15 min, 80 ℃ 15 min)后进行延伸反应.
| 位点 | 上游引物 | 下游引物 | PCR产物(bp) |
| rs1004819 | TGCACTGACCTGCTTTATGC | TAAGCACCCTCAAGGCCATA | 207 |
| rs10489629 | TCGTGGACTTTAGATGCCATT | CCCAGTTTCCGCTTTTGTAA | 210 |
| rs11805303 | TCCCAGTCTCCAGTGTGTCTT | AAAAGGCAAGTGGATCGTTT | 208 |
| rs2201841 | TCAAGAACTCTGCCCACCTT | GATTTCAGCCCAGTGGTTGT | 227 |
| rs1495965 | CCCATGGCTCTTTCCAGTTA | GAACTGAGGCCTAGCTTTGG | 235 |
| rs1343151 | TTTTTCCCTCCTGTGATGGT | AGCAAATGATGGCAAGAAGG | 242 |
| rs17375018 | CCTGAATCTCCCCTTCACTG | GCCCAGCCCTCTTCTCTAAT | 353 |
| rs1884444 | TGCTCTGTTTCCTTCCTTCC | CCATGACACCAGCTGAAGAGTA | 256 |
| rs10889677 | CATGTTTTCATTTCCCTTGGA | TCCACCTTCGGGACCTTAAT | 219 |
1.2.3 SNaPshot多重单碱基延伸反应: 延伸引物(表2), 反应条件(退火温度52 ℃, 延伸温度60 ℃), 延伸产物纯化.
| 位点 | 等位基因 | 延伸引物 |
| rs1004819 | [A/G] | CCTGCTTTATGCTGTGATTCTTACT |
| rs10489629 | [C/T] | TTTTTTTTGTTTGATTATGATGTCAGCCA |
| rs11805303 | [C/T] | TTTTTTTTTTAATAAAAGGCAAGTGGATCGTTT |
| rs2201841 | [A/G] | TTTTTTTTTTTTTTTGCCTATGATTATGCTTTTTCTTGA |
| rs1495965 | [C/T] | TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGCTTTGGAAAATGTTCTCTTC |
| rs1343151 | [A/G] | TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACTTGAATGTTCTTTGCC |
| rs17375018 | [A/G] | TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAATAAAATCCCATTAATCTGGC |
| rs1884444 | [G/T] | TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGCTTCCAGACATGAATCA |
| rs10889677 | [A/C] | TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTAGCCATTCTTCTGCCT |
1.2.4 分析: 延伸产物上ABI3730XL测序仪, 收集的原始数据用GeneMapper4.1(AppliedBiosystems Co., Ltd., United States)来分析.
统计学处理 所有组别进行Hardy-Weinberg 遗传平衡检验确定样本群体的代表性. 计数资料直接给出具体数值. 基因频率采用直接计数法. 两组基因频数及等位基因频数的比较采用卡方检验. 统计均采用SPSS19.0进行分析, P<0.05差异有统计学意义.
可见各组性别构成及年龄方面差异无统计学意义(P>0.05), 维吾尔族与汉族UC组及正常对照组性别构成及年龄方面资料数据平衡(表3).
| 维吾尔族 | 汉族 | χ2或t值 | P值 | |
| UC患者例数 | 92 | 89 | ||
| UC患者年龄(岁) | 38.30±11.46 | 37.53±10.69 | 0.27 | 0.79 |
| UC患者例数(女/男) | 30/62 | 27/62 | 2.61 | 0.11 |
| 正常对照组例数 | 45 | 37 | ||
| 正常对照组年龄(岁) | 37.77±10.70 | 37.53±10.84 | 0.08 | 0.93 |
| 正常对照组例数(女/男) | 18/27 | 17/20 | 0.29 | 0.59 |
本研究探讨了263个样本的9个SNP位点基因型, 分别对比维吾尔族UC组与维吾尔族对照组、汉族UC组与汉族对照组、维吾尔族UC组与汉族UC组, Hardy-Weinberg平衡检验各组均达到遗传平衡群体(P>0.05), 每组样本均具有群体代表性.
在9个SNP位点中, 与维吾尔族对照组相比, 维吾尔族UC组在rs11805303、rs17375018位点基因频数分布上差异有统计学意义(P<0.05). 其中: 基因rs11805303位点上, 维吾尔族UC组基因型(TT 53.3% TC37% CC9.8%), 维吾尔族对照组(TT 33.3% TC42.2% CC24.4%), 等位基因C出现增多为保护因素. 基因rs17375018位点上, 维吾尔族UC组基因型(GG 78.3% GA 21.7% AA 0.0%), 维吾尔族对照组(GG 55.6% GA 44.4% AA 0.0%), GA型的基因型出现增多为保护因素(表4).
| SNP位点 | 等位基因(1/2) | 分组 | 基因型 | χ2值 | P值 | MAF | χ2值 | P值 | OR值 | ||
| 1/1 | 1/2 | 2/2 | |||||||||
| rs1004819 | T/C | 维吾尔族UC组 | 47(0.511) | 34(0.370) | 11(0.120) | 0.026 | 0.270 | 0.304 | 1.070 | 0.301 | 0.756 |
| 维吾尔族对照组 | 17(0.378) | 23(0.511) | 5(0.111) | 0.367 | |||||||
| rs1495965 | A/G | 维吾尔族UC组 | 22(0.239) | 39(0.424) | 22(0.239) | 0.014 | 0.508 | 0.451 | 0.581 | 0.446 | 0.822 |
| 维吾尔族对照组 | 11(0.244) | 23(0.511) | 11(0.244) | 0.500 | |||||||
| rs1884444 | T/G | 维吾尔族UC组 | 47(0.511) | 36(0.391) | 9(0.098) | 0.000 | 0.985 | 0.293 | 0.006 | 0.937 | 1.022 |
| 维吾尔族对照组 | 23(0.511) | 18(0.400) | 4(0.089) | 0.289 | |||||||
| rs2201841 | C/T | 维吾尔族UC组 | 48(0.522) | 38(0.413) | 6(0.065) | 0.020 | 0.373 | 0.272 | 1.534 | 0.215 | 1.408 |
| 维吾尔族对照组 | 20(0.444) | 19(0.422) | 6(0.133) | 0.344 | |||||||
| rs10489629 | A/G | 维吾尔族UC组 | 59(0.641) | 27(0.293) | 6(0.065) | 0.000 | 0.975 | 0.212 | 0.038 | 0.846 | 1.062 |
| 维吾尔族对照组 | 28(0.622) | 14(0.311) | 3(0.067) | 0.222 | |||||||
| rs10889677 | A/C | 维吾尔族UC组 | 41(0.446) | 38(0.413) | 13(0.141) | 0.000 | 0.990 | 0.348 | 0.003 | 0.956 | 0.985 |
| 维吾尔族对照组 | 20(0.444) | 19(0.422) | 6(0.133) | 0.344 | |||||||
| rs1343151 | C/T | 维吾尔族UC组 | 85(0.924) | 7(0.076) | 0(0.000) | 0.476 | 0.490 | 0.038 | 0.493 | 0.483 | 0.575 |
| 维吾尔族对照组 | 43(0.956) | 2(0.044) | 0(0.000) | 0.022 | |||||||
| rs11805303 | T/C | 维吾尔族UC组 | 49(0.533) | 34(0.370) | 9(0.098) | 0.072 | 0.027 | 0.283 | 8.063 | 0.005 | 0.471 |
| 维吾尔族对照组 | 15(0.333) | 19(0.422) | 11(0.244) | 0.456 | |||||||
| rs17375018 | G/A | 维吾尔族UC组 | 72(0.783) | 20(0.217) | 0(0.000) | 7.536 | 0.006 | 0.109 | 6.248 | 0.012 | 0.427 |
| 维吾尔族对照组 | 25(0.556) | 20(0.444) | 0(0.000) | 0.222 | |||||||
在9个SNP位点中, 与汉族对照组相比, 汉族UC组在rs1495965、rs11805303、rs17375018基因频数分布上差异有统计学意义(P<0.05). 其中: 基因rs1495965位点上, 汉族UC组基因型(AA 16.9% AG 39.3% GG 43.8%), 汉族对照组(AA 27.0% AG 54.1% GG 18.9%), 等位基因A出现增多为保护因素. 基因rs11805303位点上, 汉族UC组基因型(TT 53.9% TC 37.1% CC 9.0%), 汉族对照组(TT29.7% TC 43.2% CC 27.0%), 等位基因C出现增多为保护因素. 基因rs17375018位点上, 汉族UC组基因型(GG 78.7% GA 21.3% AA 0.0%), 汉族对照组(GG 56.8% GA 43.2% AA 0.0%), GA型的基因型出现增多为保护因素(表5).
| SNP位点 | 等位基因(1/2) | 分组 | 基因型 | χ2值 | P值 | MAF | χ2值 | P值 | OR值 | ||
| 1/1 | 1/2 | 2/2 | |||||||||
| rs1004819 | T/C | 汉族UC组 | 46(0.517) | 32(0.360) | 11(0.124) | 0.036 | 0.169 | 0.303 | 0.555 | 0.456 | 0.804 |
| 汉族对照组 | 14(0.378) | 20(0.541) | 3(0.081) | 0.351 | |||||||
| rs1495965 | A/G | 汉族UC组 | 15(0.169) | 35(0.393) | 39(0.438) | 0.071 | 0.029 | 0.365 | 6.614 | 0.010 | 0.489 |
| 汉族对照组 | 10(0.270) | 20(0.541) | 7(0.189) | 0.459 | |||||||
| rs1884444 | T/G | 汉族UC组 | 49(0.557) | 31(0.352) | 8(0.091) | 0.002 | 0.896 | 0.267 | 0.239 | 0.625 | 0.861 |
| 汉族对照组 | 19(0.514) | 14(0.378) | 4(0.108) | 0.297 | |||||||
| rs2201841 | C/T | 汉族UC组 | 44(0.494) | 36(0.404) | 9(0.101) | 0.009 | 0.652 | 0.303 | 0.096 | 0.757 | 0.910 |
| 汉族对照组 | 18(0.486) | 17(0.459) | 2(0.054) | 0.284 | |||||||
| rs10489629 | A/G | 汉族UC组 | 56(0.629) | 27(0.303) | 6(0.067) | 0.001 | 0.964 | 0.219 | 0.034 | 0.853 | 1.063 |
| 汉族对照组 | 23(0.622) | 11(0.297) | 3(0.081) | 0.230 | |||||||
| rs10889677 | A/C | 汉族UC组 | 40(0.449) | 37(0.416) | 12(0.135) | 0.002 | 0.890 | 0.343 | 0.017 | 0.895 | 1.039 |
| 汉族对照组 | 17(0.459) | 14(0.378) | 6(0.162) | 0.351 | |||||||
| rs1343151 | C/T | 汉族UC组 | 83(0.933) | 6(0.067) | 0(0.000) | 0.592 | 0.442 | 0.034 | 0.568 | 0.451 | 1.638 |
| 汉族对照组 | 33(0.892) | 4(0.108) | 0(0.000) | 0.054 | |||||||
| rs11805303 | T/C | 汉族UC组 | 48(0.539) | 33(0.371) | 8(0.090) | 0.095 | 0.009 | 0.275 | 10.431 | 0.001 | 0.401 |
| 汉族对照组 | 11(0.297) | 16(0.432) | 10(0.270) | 0.486 | |||||||
| rs17375018 | G/A | 汉族UC组 | 70(0.787) | 19(0.213) | 0(0.000) | 6.245 | 0.012 | 0.107 | 5.238 | 0.022 | 0.433 |
| 汉族对照组 | 21(0.568) | 16(0.432) | 0(0.000) | 0.216 | |||||||
与汉族UC组相比, 维吾尔族UC组在上述9个SNP位点的基因频数分布上均差异无统计学意义(P>0.05, 表6).
| SNP位点 | 等位基因(1/2) | 分组 | 基因型 | χ2值 | P值 | ||
| 1/1 | 1/2 | 2/2 | |||||
| rs1004819 | T/C | 维吾尔族UC组 | 47(0.511) | 34(0.370) | 11(0.120) | 0.000 | 0.989 |
| 汉族UC组 | 46(0.517) | 32(0.360) | 11(0.124) | ||||
| rs1495965 | G/A | 维吾尔族UC组 | 31(0.337) | 39(0.424) | 22(0.239) | 0.024 | 0.300 |
| 汉族UC组 | 39(0.438) | 35(0.393) | 15(0.169) | ||||
| rs1884444 | T/G | 维吾尔族UC组 | 47(0.511) | 36(0.391) | 9(0.098) | 0.004 | 0.825 |
| 汉族UC组 | 49(0.557) | 31(0.352) | 8(0.091) | ||||
| rs2201841 | C/T | 维吾尔族UC组 | 48(0.522) | 38(0.413) | 6(0.065) | 0.008 | 0.678 |
| 汉族UC组 | 44(0.494) | 36(0.404) | 9(0.101) | ||||
| rs10489629 | A/G | 维吾尔族UC组 | 59(0.641) | 27(0.293) | 6(0.065) | 0.000 | 0.986 |
| 汉族UC组 | 56(0.629) | 27(0.303) | 6(0.067) | ||||
| rs10889677 | A/C | 维吾尔族UC组 | 41(0.446) | 38(0.413) | 13(0.141) | 0.000 | 0.992 |
| 汉族UC组 | 40(0.449) | 37(0.416) | 12(0.135) | ||||
| rs1343151 | C/T | 维吾尔族UC组 | 85(0.924) | 7(0.076) | 0(0.000) | 0.051 | 0.821 |
| 汉族UC组 | 83(0.933) | 6(0.067) | 0(0.000) | ||||
| rs11805303 | T/C | 维吾尔族UC组 | 49(0.533) | 34(0.370) | 9(0.098) | 0.000 | 0.983 |
| 汉族UC组 | 48(0.539) | 33(0.371) | 8(0.090) | ||||
| rs17375018 | G/A | 维吾尔族UC组 | 72(0.783) | 20(0.217) | 0(0.000) | 0.004 | 0.949 |
| 汉族UC组 | 70(0.787) | 19(0.213) | 0(0.000) | ||||
UC的病因目前尚不明确, 可能与环境、遗传、免疫、饮食等因素有关. 较多观点认为, UC是携带遗传易感基因的宿主在环境因素作用下, 自身免疫功能紊乱导致的一种非特异性炎性反应性疾病. 近年来中国UC的发病率呈逐年上升趋势[19].
新疆具有特殊的地理位置和气候, 维吾尔族和汉族人群存在明显不同的生活方式和饮食习惯, 遗传背景存在显著差异, UC的临床特点亦存在差异, 有研究[10,20,21]表明: 维吾尔族UC检出率明显高于汉族, 且发病年龄小于汉族, 农村患者比例、伴有里急后重和明显消瘦比例以及抗中性粒细胞胞浆抗体阳性率均高于汉族, 而导致这种差异可能与遗传背景相关, 研究表明, 同卵双生人群中的UC患病一致率为5%-20%, 当一级亲属中有UC患者时, UC患病风险会明显上升, 故其易感基因位点成为UC研究的热点之一.
IL-23是目前针对自身免疫性疾病研究的细胞因子热点, 有研究发现IL-23及其受体在IBD患者炎症肠黏膜组织中表达升高, IL-23可诱导IBD患者淋巴细胞分泌高水平的炎性介质, 考虑IL-23参与了肠黏膜炎症损伤[8,22]. IL-23功能的实现依赖于其受体IL23R, IL23R定位于染色体1p32.1-p31.2, 编码区2.9×103, 由11个外显子组成[23]. 他可以通过结合细胞膜表面IL-23R复合物, 刺激细胞内信号传导系统, 如JAK2、STAT3途径引起肠黏膜非特异性炎症反应, IL-23/IL-17轴在UC的发展中也起着重要作用[24-27].
个体基因多态性的主要形式是SNP, 是公认的"第3代DNA遗传标记", 也是目前全世界基因研究领域的热点之一. 国外多个研究小组通过基因扫描的方法分别对欧洲高加索人、英国、法国、德国和加拿大等地的UC患者进行研究, 发现IL-23R基因多态性与UC患者易感性显著相关. 沈方程等[11]研究了中国UC发病易感性和IL-23R的rs1004819、rs1495965、rs1884444、rs2201841、rs6677188、rs7517847、rs7530511、rs10489629、rs10889677、rs11209026位点SNP间的关系, 发现 IL-23R rs7530511位点突变是UC的保护性因素, rs6677188多态性与患者年龄和内镜下缓解与否有关. Duerr等[12]发现IL-23R的rs10889677、rs1004819、rs2201841、rs11805303、rs11209032位点与UC的易感性相关. 谢庆云等[28]发现: rs10889677与类风湿关节炎之间存在相关性, 从功能学上分析, rs10889677位于3'-UTR端, 可能会通过增加mRNA的稳定性使得IL-23R过度表达, 促进T细胞向Th17细胞亚群分化, 最终引起炎性细胞因子升高促发炎症反应. Safrany等[13]研究了UC患者IL-23R上的rs1884444、rs11805303、rs7517847、rs2201841、rs10889677和rs11209032位点基因突变情况, 发现rs1884444增加UC的风险.
新疆维吾尔自治区是一个多民族聚集的区域, 因前期研究已显示出维汉民族间UC患者临床表现的差异, 本研究通过查阅大量文献, 对两个民族的UC患者与正常人群做了IL-23R上的9个与UC发病可能相关的SNP位点进行研究. 结果表明IL-23R基因的rs1495965、rs11805303、rs17375018位点可能是影响UC发病的易感位点, 其中rs11805303与溃疡性结肠炎的易感关系分析中, 与Yu等[14]及陈正彦等[15]的研究一致, 其影响基因功能的机制尚不清楚, 可能是由于碱基的改变影响该基因的转录或转录后mRNA的剪切, 甚至作为一个远程控制元件影响该基因的功能. rs1495965、rs17375018作为UC的易感基因, 与Einarsdottir等[16]的研究一致. 但本研究涉及IL-23R基因9个SNP位点基因型在维汉民族间无明显差异, 考虑上述位点可能不是民族易感性位点.
基因多态性研究对认识疾病易感基因、探明发病机制、评价疾病严重程度及预后、指导治疗有着重要意义, 如Cravo等[17]的发现: IL23R的位点基因多态性与有肠外反应的UC患者及对5-ASA复合物和激素无反应的患者相关.
因本研究所选的样本数量仍较少, 为小样本的初步研究, 而新疆维吾尔自治区属于一个多民族聚集地区, 仍需后续大样本、多民族、多个位点的研究, 探索民族及疾病方面的易感基因位点, 为新疆维吾尔自治区多民族溃疡性结肠炎患者、正常对照人群留取更加全面的基线资料, 并为后续的治疗提供更好的依据.
溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)是一种慢性、非特异性的肠道炎症性疾病, 在我国的发病率逐年增高, 国内外大量研究认为UC的发病可能与遗传、免疫密切相关, 白介素23受体(interleukin-23 receptor, IL-23R)在UC的发生发展中有着重要作用, 其发病还有一定种族和地区差异. 本研究选择维汉UC患者及对照组IL-23R基因中9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点进行研究, 以探讨IL-23R与UC易感性的关系及其是否在遗传基因方面存在民族差异性.
个体基因多态性的主要形式是SNP, 是公认的"第三代DNA遗传标记", 也是目前全世界基因研究领域的热点之一. 国外多个研究小组通过基因扫描的方法分别对欧洲高加索人、英国、法国、德国和加拿大等地的UC患者进行研究, 发现IL-23R基因多态性与UC患者易感性显著相关.
沈方程等研究了中国UC发病易感性和IL-23R的rs1004819、rs1495965、rs1884444、rs2201841、rs6677188、rs7517847、rs7530511、rs10489629、rs10889677、rs11209026位点SNP间的关系, 发现IL-23R rs7530511位点突变是UC的保护性因素, rs6677188多态性与患者年龄和内镜下缓解与否有关. Duerr发现IL-23R的rs10889677、rs1004819、rs2201841、rs11805303、rs11209032位点与UC的易感性相关. Yu及陈正彦的研究考虑rs11805303与UC的易感性相关, Einarsdottir考虑rs1495965、rs17375018是UC的易感基因.
该研究为新疆维吾尔自治区多民族UC患者、正常对照人群留取更加全面的基线资料, 包括相关基因多态性方面资料, 并为后续的研究、治疗提供更好的依据.
基因多态性研究对认识疾病易感基因、探明发病机制、评价疾病严重程度及预后、指导治疗有着重要意义, 后续可结合新疆地区不同民族UC患者基因多态性情况提供更好的治疗依据.
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP): 基因组DNA序列中由于单个核苷酸的突变而引起的多态性. 一个SNP指在基因组某个位点上有一个核苷酸的变化, 源于单个碱基的转换或颠换.
迟雁, 博士, 副教授, 北京大学第一医院消化内科; 霍丽娟, 博士, 山西医科大学第一医院消化内科
本文有一定的临床创新性和临床意义, 但作为基因多态性的研究, 样本量偏小, 作为机制研究, 研究位点数偏少, 仍需后续大样本、多民族、多个位点的研究, 探索民族及疾病方面的易感基因位点.
手稿来源: 自由投稿
学科分类: 胃肠病学和肝病学
手稿来源地: 新疆维吾尔自治区
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编辑:马亚娟 电编:杜冉冉
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