GEO基因芯片分析结合网络药理学及分子对接技术探析"黄连-木香-肉豆蔻"组方治疗溃疡性结肠炎的分子机制

图1 UC差异基因分析. A: 火山图; B: 热图. 红色: 上调基因; 绿色: 下调基因; 黑色: 无差异基因; UC: 溃疡性结肠炎; FC: 差值倍数.

图2 HMR治疗UC的"中药-活性成分-疾病-靶点"网络图. HMR: 黄连-木香-肉豆蔻; UC: 溃疡性结肠炎; MMP9: 基质金属蛋白酶9; MMP3: 基质金属蛋白酶3; MMP1: 基质金属蛋白酶1; GJA1: 缝隙连接蛋白α; IL-6: 白介素6; IL-1β: 白介素1β; ICAM-1: 细胞间黏附分子-1; Fos: 原癌基因蛋白; EGF: 表皮生长因子; DUOX2: 双氧化酶; CXCL2: CXC趋化因子配体2; CXCL11: CXC趋化因子配体11; CXCL10: CXC趋化因子配体10; CCL2: CC趋化因子配体2; BCL2: 结合蛋白B细胞淋巴瘤/白血病-2; VCAM1: 血管细胞粘附分子1; TNF: 肿瘤坏死因子; THBD: 血栓调节素; STAT1: 信号传导转录激活因子1; SPP1: 分泌磷蛋白1; SELE: E选择素; PTGS2: 环加氧酶2; PPARg: 过氧化物酶体增殖物激活受体γ; PLAU: 尿激酶型纤维蛋白溶酶原激活因子; PCOLCE: 前胶原C-蛋白酶增强蛋白; NR3C2: 核受体亚家族C组成员2; NOS2: 诱导型一氧化氮合酶; NFKBIA: 核因子κB抑制剂α.

图3 HMR治疗UC的PPI网络. HMR: 黄连-木香-肉豆蔻; UC: 溃疡性结肠炎; PPI: 蛋白互作; Degree: 度值; MMP9: 基质金属蛋白酶9; MMP3: 基质金属蛋白酶3; MMP1: 基质金属蛋白酶1; GJA1: 缝隙连接蛋白α; IL-6: 白介素6; IL-1β: 白介素1β; ICAM-1: 细胞间黏附分子-1; Fos: 原癌基因蛋白; EGF: 表皮生长因子; DUOX2: 双氧化酶; CXCL2: CXC趋化因子配体2; CXCL11: CXC趋化因子配体11; CXCL10: CXC趋化因子配体10; CCL2: CC趋化因子配体2; VCAM1: 血管细胞粘附分子1; TNF: 肿瘤坏死因子; THBD: 血栓调节素; STAT1: 信号传导转录激活因子1; SPP1: 分泌磷蛋白1; SELE: E选择素; PTGS2: 环加氧酶2; PPARg: 过氧化物酶体增殖物激活受体γ; PLAU: 尿激酶型纤维蛋白溶酶原激活因子; NR3C2: 核受体亚家族C组成员2; NOS2: 诱导型一氧化氮合酶; NFKBIA: 核因子κB抑制剂α.

图4 HMR治疗UC的GO分析. HMR: 黄连-木香-肉豆蔻; UC: 溃疡性结肠炎; GO: 基因本体; BP: 生物过程; MF: 分子功能; CC: 细胞组分.

图5 HMR治疗UC的KEGG分析. HMR: 黄连-木香-肉豆蔻; UC: 溃疡性结肠炎; KEGG: 京都基因与基因组百科全书; TNF: 肿瘤坏死因子; HIF-1: 缺氧诱导因子1.

图6 活性成分与关键靶点的分子对接模式. 绿色: 配体; 黄色: 与配体对接的氨基酸残基; 红色虚线: 氢键; IL-1β: 白介素1β; IL-6: 白介素6; CCL2: 趋化因子配体2; TNF: 肿瘤坏死因子; MMP9: 基质金属蛋白酶9.