转录组测序结合蛋白组学技术筛选肝癌转移基因

图1 肝癌细胞中明显表达差异的转移相关功能基因. 正值表示与对照相比基因在肝癌细胞中表达水平明显增高, 负值表示明显降低. CTGF: 结缔组织生长因子; LSP1: 淋巴细胞特异性蛋白1; cks2: 正周期蛋白依赖性激酶亚基2; RPS12: 结核分支杆菌重组蛋白rps12; DDR1: 盘状结构域受体1; Cks1b: CDC28蛋白激酶调节亚基1B; Tead1: TEA域家庭成员1; GLCE: 葡萄糖醛酸差向异构酶; SUB1: SUB1同族体; LIFR:白血病抑制因子受体; EGR1: 早期生长转录因子; RBP4: 视黄醇结合蛋白4; KCTD12: 钾通道四聚域12; IL32:白介素32; FTL: 铁蛋白轻链; S100A4: 钙结合蛋白S100A4; HSBP1: 热休克因子结合蛋白1; LOXL1: 赖氨酰氧化酶样蛋白1; Lsm3: LSM3同族体; CAPG: 肌动蛋白调节蛋白; RPL29: 核糖体蛋白L29; RPS27: 核糖体蛋白S27; MT1E: 金属硫蛋白1E; HSP90AA1: 热休克蛋白90 AA1; CCND3:细胞周期素D3; Tpm3: 人原肌球蛋白3.

图2 iTRAQ筛选的肝癌血清差异表达蛋白相互作用图. SERPINA1: 抗胰蛋白酶; SAA1: 血清淀粉样蛋白A; CRP: C反应蛋白; HP: 结合珠蛋白; SERPING1: 血浆蛋白酶C1抑制剂; LRG1: 富亮氨酸α-2糖蛋白; SERPINA3: 抗胰凝乳蛋白酶; ORM1: α-1酸性糖蛋白; ITIH3: 间α胰蛋白酶抑制剂重链H3; C1QC: 补体C1q子亚基C; HSP90AA1: 热休克蛋白90 AA1; C9: 补体成分9; CFB: 补体因子B; APOA4: 载脂蛋白A-Ⅳ; APOA1: 载脂蛋白A-Ⅰ; GSN: 凝溶胶蛋白; ACTA1: 肌动蛋白α骨骼肌; PON1: 芳香酯酶1(对氧磷酶); ITIH1: 间α胰蛋白酶抑制剂重链H1; APCS: 血清淀粉样P物质; THBS1: 血小板反应素-1; RBP4: 视黄醇结合蛋白4; APOC3: 载脂蛋白C3; ALB: 血清白蛋白; CFHR1: 人补体因子H相关蛋白1; iTRAQ: 相对和绝对定量的同位素标记.

图3 蛋白质组学与转录组学交集维恩图.

图4 免疫组织化学法验证HSP90α在组织中的表达. A: HSP90α阴性(观察倍数×200); B: HSP90α强阳性(观察倍数×200); C: 不同表达等级在MI与NMI的分布. ^bP<0.01 vs NMI组. MI: 转移; NMI: 非转移; HSP90α: 热休克蛋白90α.