Analysis of spontaneous, gamma ray- and ethylnitrosourea-induced hprt mutants in HL-60 cells with multiplex PCR

doi:10.3748/wjg.v9.i3.578

Advanced Search

BPG is committed to discovery and dissemination of knowledge

Home / Archive / Volume 9, Issue 3

This Article

Citation of this article

Corresponding Author of This Article

Article-Type of This Article

Open-Access Policy of This Article

Times Cited Counts in Google of This Article

Number of Hits and Downloads for This Article

Total Article Views (2540)

All Articles published online

The chart showing PDF series, HTML series, Figures (1-3) series, Tables (1-4) series.

Item

Count

PDF

269

HTML

2021

Figures (1-3)

124

Tables (1-4)

126

Sum=2540

Mar 15, 2003 (publication date) through May 1, 2024

Times Cited of This Article

Times Cited (8)

Journal Information of This Article

Publication Name

World Journal of Gastroenterology

ISSN

1007-9327

Publisher of This Article

Baishideng Publishing Group Inc, 7041 Koll Center Parkway, Suite 160, Pleasanton, CA 94566, USA

Basic Research

World J Gastroenterol. Mar 15, 2003; 9(3): 578-583
Published online Mar 15, 2003. doi: 10.3748/wjg.v9.i3.578

Table 1 Oligonucleotide primers in multiplex PCR of the hu-man HPRT locus

Exons	Primers sequence (5’-3’)	Fragment size (bp)
1	F TGG GAC GTC TGG TCC AAG GAT TCA	626
	R CCG AAC CCG GGA AAC TGG CCG CCC
2	F CCT GAT ATG CTC TCA TTG AAA CA	211
	R GCT GCT GAT GTT TGA AAT TAA CAC
3	F GTT TAA TGA CTA AGA GGT GTT TG	311
	R GAA AAC CTA GTG TTG CCA CAT AA
4	F GTG TGT GTA CAT AAG GAT ATA CA	165
	R TTC TTC CCT TTC AAG ATA CAT AC
5	F GGA AAT ACC GTT TTA TTC ATT GT	125
	R GTG CAT ACT AAG TTA GAA AGG TC
6	F GTG ACT CTG AAT TTA AAG CTA TG	150
	R CTG TGT CAA AAT GTC ATA CAT AC
7/8	F GTC TCT CTG TAT GTT ATA TGT CAC	379
	R TGC GTG TTT TGA AAA ATG AGT GAG
9	F GCT ATT CTT GCC TTT CAT TTC AG	136
	R CAA ACT CAA CTT GAA CTC TCA TC

Table 2 Cytotoxicity and mutagenicity of γ-rays and ENU in HL-60 cells

Type	Dose	PE(%)	CE(%)	MF( × 10^-6)
Control (μg/mL)	0.0	93.01	86.64	5.13
ENU (μg/mL)	12.5	75.92	85.91	17.73^a
	25.0	70.67	78.62	31.18^b
	50.0	61.45	82.67	64.45^b
	100.0	45.77^b	83.91	82.61^b
	200.0	25.63^b	67.02	106.70^b
γ-ray (Gy)	0.5	91.63	146.0^b	12.30
	1.0	69.31	186.0^b	18.30^b
	2.0	55.34^a	108.2	23.20^a
	4.0	39.94^b	69.0	73.00^b

^aP < 0.05 vs control group,

^bP < 0.01 vs control group.

Table 3 Summary of multiplex PCR analysis of THH-induced HPRT mutants in HL-60 cells

Categories of mutation	Number analyzed	Number showing PCR changes		Percentage deleted	Number showing no change
Categories of mutation	Number analyzed	Complete deletion	Partial deletion		Number showing no change
Spontaneous	13	0	1/13 (7.7%)	Percentage deleted	7.7%	12/13 (92.3%)
ENU (μg/mL)
12.5	8	1/8 (12.5%)	4/8 (50.0%)^a	62.5%^b	3/8 (37.5%)^a
25.0	10	2/10 (20.0%)	5/10 (50.0%)^a	70.0%^b	3/10 (30.0%)^b
50.0	10	2/10 (20.0%)	6/10 (60.0%)^b	80.0%^b	2/10 (20.0%)^b
100.0	12	4/12 (33.3%)^a	6/12 (50.0%)^a	83.3%^b	2/12 (16.7%)^b
200.0	19	7/19(36.8%)^a	10/19 (52.6%)^a	89.4%^b	2/19 (10.6%)^b
γ-rays (Gy)
0.5	7	1/7 (14.3%)	1/7 (14.3%)	28.6%	5/7 (71.4%)
1.0	13	3/13 (23.1%)	5/13 (38.5%)	61.5%^b	5/13 (38.5%)^b
2.0	10	3/10 (30.0%)^a	3/10 (30.0%)	60.0%^b	4/10 (40.0%)^b
4.0	17	7/17 (41.2%)^b	6/17(35.3%)	76.5%^b	4/17 (23.5%)^b

^aP < 0.05 vs control group,

^bP < 0.01 vs control group.

Table 4 Schematic diagram of the distribution of deletion within nine exons of the human HPRT gene

	^{Types of exons deletion}								^{Mutation clones}
	¹	²	³	⁴	⁵	⁶	^7/8	⁹	^Number	^{Percent (%)}
^{Spontaneous mutants}									¹²	^92.3
					^—a				¹	^7.7
^{ENU-induced mutants}									¹²	^20.3
	^—								³	^5.1
			^—						²	^3.4
				^—	^—				⁴	^6.8
					^—				²	^3.4
			^—					^—	¹	^1.7
	^—	^—	^—						²	^3.4
		^—	^—	^—					²	^3.4
				^—	^—	^—	^—		²	^3.4
						^—	^—	^—	¹	^1.7
		^—	^—				^—	^—	¹	^1.7
				^—	^—	^—	^—	^—	³	^5.1
		^—	^—	^—	^—	^—	^—	^—	¹	^1.7
	^—	^—	^—	^—	^—	^—	^—	^—	¹⁶	^27.1
		^—	^—	^—	^—			^—	¹	^1.7
	^—				^—	^—	^—		¹	^1.7
		^—			^—				²	^3.4
		^—		^—		^—	^—		²	^3.4
					^—	^—			¹	^1.7
^{r-rays-induced mutants}									¹⁸	^38.3
			^—						¹	^2.1
	^—	^—							¹	^2.1
			^—	^—					²	^4.3
	^—	^—	^—						²	^4.3
						^—	^—	^—	¹	^2.1
	^—	^—	^—	^—					¹	^2.1
					^—	^—	^—	^—	³	^6.4
	^—	^—	^—				^—	^—	¹	^2.1
				^—	^—	^—	^—	^—	¹	^2.1
		^—	^—	^—	^—	^—	^—	^—	²	^4.3
	^—	^—	^—	^—	^—	^—	^—	^—	¹⁴	^29.8

^adeletion of a exon.

Citation: Liu SX, Cao J, An H, Shun HM, Yang LJ, Liu Y. Analysis of spontaneous, gamma ray- and ethylnitrosourea-induced hprt mutants in HL-60 cells with multiplex PCR. World J Gastroenterol 2003; 9(3): 578-583
URL: https://www.wjgnet.com/1007-9327/full/v9/i3/578.htm
DOI: https://dx.doi.org/10.3748/wjg.v9.i3.578