Programmed death 1, ligand 1 and 2 correlated genes and their association with mutation, immune infiltration and clinical outcomes of hepatocellular carcinoma

Table 1 Co-mutation analysis for programmed death 1/programmed death ligand 1/programmed death ligand 2

Gene	Mutation	PD-1 (mean ± SD)	PD-1 P value	PD-L1 (mean ± SD)	PD-L1 P value	PD-L2 (mean ± SD)	PD-L2 P value
ABCA13	NO	0.38 ± 1.47		0.14 ± 0.54		0.34 ± 3.31
	Yes	0.3 ± 0.69	0.675	0.1 ± 0.21	0.431	0.08 ± 0.1	0.705
ALB	NO	0.38 ± 1.46		0.14 ± 0.53		0.33 ± 3.26
	Yes	0.11 ± 0.23	0.242	0.12 ± 0.27	0.545	0.11 ± 0.27	0.121
APOB	NO	0.39 ± 1.46		0.14 ± 0.53		0.34 ± 3.27
	Yes	0.04 ± 0.05	0.102	0.05 ± 0.03	0.858	0.05 ± 0.04	0.835
ARID1A	NO	0.37 ± 1.43		0.14 ± 0.52		0.33 ± 3.22
	Yes	0.59 ± 1.03	0.316	0.1 ± 0.14	0.699	0.13 ± 0.17	0.495
AXIN1	NO	0.37 ± 1.43		0.14 ± 0.52		0.32 ± 3.2
	Yes	0.16 ± 0.08	0.206	0.06 ± 0.02	0.418	0.03 ± 0	0.741
CACNA1E	NO	0.39 ± 1.48		0.14 ± 0.53		0.34 ± 3.32
	Yes	0.13 ± 0.44	0.046	0.09 ± 0.26	0.083	0.07 ± 0.17	0.076
CSMD3	NO	0.35 ± 1.42		0.14 ± 0.53		0.34 ± 3.29
	Yes	0.67 ± 1.49	0.286	0.07 ± 0.09	0.981	0.12 ± 0.14	0.633
CTNNB1	NO	0.43 ± 1.61		0.17 ± 0.6		0.42 ± 3.75
	Yes	0.22 ± 0.75	0.02	0.06 ± 0.1	0.428	0.07 ± 0.09	0.554
FLG	NO	0.39 ± 1.48		0.1 ± 0.27		0.13 ± 0.55
	Yes	0.22 ± 0.52	0.78	0.49 ± 1.53	0.893	2.34 ± 10.8	0.204
LRP1B	NO	0.39 ± 1.48		0.14 ± 0.54		0.34 ± 3.32
	Yes	0.2 ± 0.41	0.519	0.1 ± 0.17	0.554	0.12 ± 0.3	0.886
MUC16	NO	0.32 ± 1.31		0.14 ± 0.55		0.35 ± 3.47
	Yes	0.64 ± 1.93	0.697	0.13 ± 0.3	0.521	0.18 ± 0.53	0.997
MUC4	NO	0.38 ± 1.44		0.14 ± 0.52		0.33 ± 3.23
	Yes	0.13 ± 0.3	0.196	0.1 ± 0.11	0.641	0.08 ± 0.1	0.753
OBSCN	NO	0.4 ± 1.49		0.1 ± 0.27		0.14 ± 0.55
	Yes	0.15 ± 0.42	0.267	0.46 ± 1.46	0.087	2.13 ± 10.37	0.518
PCLO	NO	0.33 ± 1.3		0.14 ± 0.54		0.35 ± 3.36
	Yes	0.75 ± 2.29	0.712	0.1 ± 0.22	0.422	0.1 ± 0.17	0.974
RYR1	NO	0.34 ± 1.29		0.14 ± 0.54		0.34 ± 3.31
	Yes	0.74 ± 2.59	0.101	0.05 ± 0.04	0.872	0.06 ± 0.05	0.705
RYR2	NO	0.36 ± 1.41		0.13 ± 0.5		0.34 ± 3.34
	Yes	0.47 ± 1.58	0.03	0.24 ± 0.67	0.113	0.12 ± 0.2	0.321
SPTA1	NO	0.39 ± 1.48		0.14 ± 0.54		0.33 ± 3.31
	Yes	0.18 ± 0.4	0.737	0.1 ± 0.21	0.201	0.15 ± 0.36	0.384
TP53	NO	0.3 ± 1.22		0.08 ± 0.18		0.1 ± 0.28
	Yes	0.65 ± 2.04	0.016	0.35 ± 1.08	0.003	1.19 ± 7.04	0.041
TTN	NO	0.45 ± 1.62		0.15 ± 0.59		0.4 ± 3.66
	Yes	0.14 ± 0.38	0.014	0.08 ± 0.18	0.291	0.08 ± 0.2	0.028
XIRP2	NO	0.31 ± 1.12		0.13 ± 0.51		0.31 ± 3.31
	Yes	1.02 ± 3.15	0.26	0.19 ± 0.63	0.235	0.39 ± 1.54	0.329

PD-1: Programmed death 1; PD-L1: Programmed death ligand 1; PD-L2: Programmed death ligand 2; SD: Standard deviation.