消化系统肿瘤标志物相关蛋白组学的研究进展

表1 蛋白质组学在筛查消化系统肿瘤生物标志物中的应用

参考文献	肿瘤类型	组学技术	来源	蛋白标志物	作用
Zhao等[20]	食管癌	基质辅助激光解吸电离飞行时间/飞行时间质谱法、差异凝胶电泳、ELISA	血液	a-2-HS-糖蛋白、富亮氨酸a-2糖蛋白	早期诊断
Zheng等[21]	食管癌	TMT、IHC	组织	组蛋白去甲基化酶、辐射敏感蛋白9A、上皮细胞转化序列2、富含半胱氨酸和组氨酸的蛋白1、tonsoku样DNA修复蛋白组合	早期诊断
Wang等[22]	食管癌	iTRAQ、二维液相色谱-串联质谱、WB	血清	ECM1	预测转移
Jin等[15]	食管癌	DIA、WB、IHC	组织	FBL	预测预后
Zhao等[23]	食管癌	TMT、IHC	组织	线粒体内膜结构域转位酶1	预测预后
Mangalaparthi等[24]	食管癌	TMT、LC-MS/MS	组织	E3泛素连接酶	治疗靶点
Liu等[25]	食管癌	TMT、IHC	组织	延伸蛋白A、SR相关CTD相关因素4	预测预后
Subbannayya等[26]	胃癌	iTRAQ、LC-MS/MS、MRM	血清	α-胰蛋白酶间抑制剂重链4、血清淀粉样蛋白A	早期诊断
Yoo等[30]	胃癌	液相色谱-电喷雾串联质谱 、label-free、MRM	血清	玻连蛋白、簇集蛋白亚型1、血小板反应蛋白1和缺乏C末端调节酪氨酸和N末端肉豆蔻酰化位点的Src相关激酶	早期诊断
Shimura等[31]	胃癌	TMT、ELISA	尿液	uTFF1、uADAM12和H. pylori组合; uTFF1、尿液BRCA1 相关 RING 结构域1和H. pylori组合	早期诊断
Shen等[32]	胃癌	LC-MS/MS、IHC	血清	SOX3	预测预后
Li等[33]	胃癌	LC-MS/MS、IHC	组织	D型多巴色素互变异构酶、胃蛋白酶原C、载脂蛋白A1结合蛋白、血红素结合蛋白	预测进展
Fan等[41]	结直肠癌	LC-MS/MS、WB、ELISA	血清	巨噬细胞甘露糖受体1、S100钙结合蛋白A9	早期诊断
Yu等[42]	结直肠癌	磁珠和基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱、WB、ELISA	血清	丝氨酸/苏氨酸激酶4	早期诊断
Quesada-Calvo等[43]	结直肠癌	label-free、IHC	组织	嗅素蛋白-4、激肽原-1和外壳蛋白 II组分	早期诊断
Okuda等[44]	结直肠癌	LC-MS/MS、ELISA	尿液	uDPEP1、uTFF1	早期诊断
Mori等[45]	结直肠癌	iTRAQ、IHC	组织	ezrin	预测预后
Sun等[46]	结直肠癌	TMT、PRM	尿液	CORO1C、肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基5和RAD23B组合; CORO1C、RAD23B、真核肽链释放因子GTP结合亚基3b和神经分化的胚胎癌衍生蛋白组合	早期诊断预测转移
Shao等[47]	结直肠癌	DIA、PRM、IHC、WB	组织	PLOD2	治疗靶点
Du等[49]	肝癌	iTRAQ、PRM、ELISA	组织、血清	醛酮还原酶1B10、组织蛋白酶A	早期诊断
Xing等[50]	肝癌	DIA、PRM	血清	HABP2、CD163、AFP 和异常凝血酶原组合	早期诊断
Zhu等[51]	肝癌	iTRAQ、WB、ELISA	尿液	尿液AFP、尿液α-1-酸性糖蛋白1	早期诊断
Jiang等[52]	肝癌	label-free	组织	SOAT1	早期诊断治疗靶点
Hu等[53]	肝癌	label-free	组织	ANGPTL6	早期诊断预测预后
Gao等[54]	肝癌	TMT、IHC	组织	PYCR2、ADH1A	预测预后
Lyu等[55]	胰腺癌	Olink Explore 1536面板	血清	REG1A、REG1B	早期诊断
Wu等[62]	胰腺癌	iTRAQ、LC-MS/MS	血清	PROZ 、TNFRSF6B	早期诊断
Liu等[63]	胰腺癌	iTRAQ、MRM	血清	载脂蛋白E、α-胰蛋白酶间抑制剂重链3、载脂蛋白A1和载脂蛋白L1组合	早期诊断
Radon等[64]	胰腺癌	十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳和液相色谱-串联质谱、ELISA	尿液	淋巴管内皮受体-1、REG1A和TFF1	早期诊断
Jiang等[65]	胰腺癌	PRM、IHC	组织	NDUFB、CEMIP2	疗效评价
Le Large等[67]	胰腺癌	LC-MS/MS	组织	钙调素/钙结合素2、胶原α-1(XI)链	预测预后

ADH1A: IA类醇脱氢酶; AFP: 甲胎蛋白; ANGPTL6: 血管生成素样蛋白-6; CEMIP2: 细胞迁移诱导透明质酸酶2; CORO1C: 冠状蛋白样肌动蛋白结合蛋白1C; DIA: 数据非依赖性采集; ECM1: 细胞外基质蛋白1; ELISA: 酶联免疫吸附测定; ezrin: ERM蛋白家族成员; FBL: 核仁纤维蛋白; HABP2: 透明质酸结合蛋白2; H. pylori: 幽门螺杆菌; label-free: 无标记定量技术; IHC: 免疫组织化学; iTRAQ: 相对和绝对定量的同位素标签; LC-MS/MS: 液相色谱-串联质谱; MRM: 重反应监测; NDUFB8: NADH脱氢酶1β亚复合物亚单位8; TMT: 串联质量标签; TNFRSF6B: 肿瘤坏死因子受体超家族成员6b; PLOD2: 赖氨酸羟化酶2; PRM: 平行反应监测; PROZ: 维生素K依赖蛋白Z; PYCR2: 吡咯啉-5-羧酸还原酶2; RAD23B: 辐射敏感蛋白23B; REG1A: 再生胰岛衍生蛋白1-α; REG1B: 再生胰岛衍生蛋白1-β; SOAT1: 甾醇O-酰基转移酶1; SOX3: 性别决定区Y相关高迁移率组框3; uADAM12: 尿液解整合素和金属蛋白酶12; uDPEP1: 尿液二肽酶1; uTFF1: 尿液三叶因子1; WB: 蛋白质免疫印迹.