螺杆菌属细菌致病基因系统进化分析

表1 螺杆菌属菌株基本信息

菌种	宿主	寄生部位	致病性	菌株	基因组编号
H. pylori[16]	人, 猴, 猫, 狗, 猪, 鼠	胃	慢性胃炎, 消化性溃疡, 胃淋巴瘤, 胃癌	FDAARGOS_298	GCF_003050665.1
				ATCC 43504	GCF_004295525.1
				NCTC 11637	GCF_900478295.1
				B659-C2	GCF_003639215.1
				280-A-EK1	GCF_006337465.1
				HUP-B14	GCF_000259235.1
				83	GCF_000213135.1
				J99	GCF_000008785.1
				MT5135	GCF_017821535.1
				HP14039	GCF_003636855.2
				LIM-008	GCF_016748795.1
				HPY	GCF_013122115.1
H. mustelae[16]	雪貂	胃	慢性胃炎	NCTC12198	GCF_900476215.1
H. felis[17]	猫, 狗	胃	慢性胃炎, 胃癌	ATCC 49179	GCF_000200595.1
H. nemestrinae[18]	猴	胃	NR	NR	NR
H. cinaedi[19]	人, 猫, 狗, 仓鼠	肠道	急性腹泻, 菌血症	DSM 5359	GCF_017979495.1
H. fennelliae[19]	人, 狗	肠道	肠炎, 菌血症	NCTC11613	GCF_900451005.1
H. muridarum[20]	鼠	胃, 肠道	胃炎	NCTC12714	GCF_900450885.1
H. acinonychis[21]	豹	胃	胃炎	NCTC12686	GCF_900461455.1
H. canis[22]	人, 猫, 狗	肝脏, 肠道	腹泻, 肝炎	CCUG 32756T	GCF_008693005.1
H. hepaticus[23]	鼠	肝肠, 肠道	肝炎, 肝癌, 炎症性肠病	ATCC 51449	GCF_000007905.1
H. pametensis[24]	鸟, 猫, 猪	肠道	NR	ATCC 51478	GCF_000518225.1
H. pullorum[25]	人, 鸡	肝脏, 肠道	胃肠炎, 慢性肝炎	CCUG 33837	GCF_017979475.1
H. bilis[26]	猫, 狗, 人	肝脏, 肠道	慢性肝炎	ATCC 51630	GCF_000765785.2
H. bizzozeronii[27]	猫, 狗, 鼠	胃	胃炎	CCUG 35545	GCA_000263275.1
H. trogontum[28]	鼠	肠道	NR	ATCC 700114	GCF_000765905.2
H. cholecystus[29]	仓鼠	胆囊	胰腺炎, 胆管炎, 肝炎	ATCC 700242	GCF_003364215.1
H. salomonis[30]	猫, 狗	胃	NR	CIP 105607	GCF_017979425.1
H. rodentium[31]	鼠	肠道	腹泻	ATCC 700285	GCF_000687535.1
H. westmeadii[32]	人	肝脏, 肠道	NR	NR	NR
H. suncus[33]	麝	胃	慢性胃炎	NR	NR
H. typhlonius[34]	鼠	肠道	盲肠炎	MIT 98-6810	GCF_000765765.2
H. canadensis[35]	人, 鹅	肝脏, 肠道	腹泻	NCTC13221	GCF_900450815.1
H. ganmani[36]	鼠	肝脏, 肠道	NR	MIT 99-5101	GCF_003364315.1
H. winghamensis[37]	人	肠道	腹泻, 胃肠炎	2015D-0170	GCF_014931175.1
H. cetorum[38]	海豚, 鲸鱼	胃	胃溃疡, 胃炎	MIT 99-5656	GCF_000259275.1
H. marmotae[39]	猫, 土拨鼠	肝脏, 肠道	肝癌	MIT 98-6070	GCF_003364255.1
H. cynogastricus[40]	狗	胃	NR	NR	GCF_900197855.1
H. anseris[41]	鹅	肠道	NR	MIT 04-9362	GCF_003364335.1
H. brantae[41]	鹅	肠道	NR	MIT 04-9366	GCF_003364205.1
H. equorum[42]	马	肠道	NR	MIT 12-6600	GCF_003364175.1
H. suis[43]	猴,猪	胃	食管及胃部炎症, 胃溃疡	DSM 19735	GCF_017979375.1
H. baculiformis[44]	猫,狗	胃	NR	NR	GCF_900197685.1
H. heilmannii[45]	人, 猫, 狗, 猪	胃	胃炎, 胃溃疡	LMG 26292	GCF_017979395.1
H. ailurogastricus[46]	猫,狗	胃	胃炎, 胃溃疡	NR	GCF_900197675.1
H. jaachi[47]	猴	胃,肝脏,肠道	肝炎, 胆囊炎, 肠炎	MIT 09-6949	GCF_000763135.2
H. apri[48]	野猪	胃, 肝脏, 肠道	NR	NR	NR
H. mehlei[49]	赤狐	胃	NR	L8b	GCF_007280785.1
H. labacensis[49]	赤狐	胃	NR	L9	GCF_003660285.1
H. vulpis[49]	赤狐	胃	NR	L2	GCF_003660395.1

NR: 无记录.