基于RNA-Seq技术的跨种属跨病因肝癌差异表达基因的筛选

表3 不同表达水平区间的基因数量统计表 n(%)

FPKM Interval	0-1	1-3	3-15	15-60	>60
HUC1	41566(72.63)	3578(6.25)	5650(9.87)	4640(8.11)	1798(3.14)
HUC2	43595(76.17)	3153(5.51)	5182(9.05)	3534(6.17)	1768(3.09)
HUC3	42720(74.64)	3072(5.37)	5268(9.20)	4340(7.58)	1832(3.20)
HUP1	43421(75.87)	3713(6.49)	5610(9.80)	3071(5.37)	1417(2.48)
HUP2	42840(74.85)	3663(6.40)	5687(9.94)	3410(5.96)	1632(2.85)
HUP3	43430(75.88)	3640(6.36)	5649(9.87)	3179(5.55)	1334(2.33)
HUNL1	43776(76.49)	3506(6.13)	5538(9.68)	3129(5.47)	1283(2.24)
HUNL2	43678(76.32)	3388(5.92)	5647(9.87)	3274(5.72)	1245(2.18)
HUNL3	42677(74.57)	3727(6.51)	5837(10.20)	3478(6.08)	1513(2.64)
TSBC	22965(64.12)	2187(6.11)	5201(14.52)	3786(10.57)	1679(4.69)
TSBP	23101(64.50)	2773(7.74)	5739(16.02)	2964(8.28)	1241(3.46)
TSFC1	21840(60.97)	2298(6.42)	5296(14.79)	4505(12.58)	1879(5.25)
TSFC2	23561(65.78)	2658(7.42)	5047(14.09)	3081(8.60)	1471(4.11)
TSFC3	23693(66.15)	2395(6.69)	5062(14.13)	3184(8.89)	1484(4.14)
TSFP1	23276(64.98)	2732(7.63)	5355(14.95)	3014(8.41)	1441(4.02)
TSFP2	24445(68.25)	2825(7.89)	4806(13.42)	2597(7.25)	1145(3.20)
TSFP3	24571(68.60)	3080(8.60)	4923(13.74)	2166(6.05)	1078(3.01)
TSNL1	24162(67.46)	2932(8.19)	4956(13.84)	2514(7.02)	1254(3.50)
TSNL2	24347(67.97)	3052(8.52)	4948(13.81)	2311(6.45)	1160(3.24)
TSNL3	24544(68.52)	3271(9.13)	4591(12.82)	2197(6.13)	1215(3.39)

HUC1、2、3为人肝癌组织标本, HUP1、2、3为相应的人肝癌癌旁组织, HUNL1、2、3为人正常肝组织标本; TSBC为HBV诱发的树鼩肝癌组织, TSBP为相应树鼩癌旁组织, TSFC1、2、3为AFB1诱发的树鼩肝癌组织, TSFP1、2、3为相应的树鼩癌旁组织, TSNL1、2、3为树鼩正常肝组织.