幽门螺杆菌上皮接触诱导基因iceA1的克隆及序列特征

表3 iceA1缺失突变及两端的核苷酸序列

缺失位置b	菌株	核苷酸序列a	缺失突变两端的重复序列	阳性缺失株数量(%)
780del6	60190	AGAATTTAATTTGGAGTTT	AGAATTT或AATTT	3/12(25.0)
	S26	AGAATTTGAATTAGAATTT
	S49	AGAATT----------- AGAATTT
809del5	60190	AAACTCTAGGAAATTCTA	AAAYTCTA	10/12(83.3)
	S26	AAACTCTAGGAAATTCTA
	S49	AAACTC----------AATTCTA
914del7	60190	GTGTGGTGTGCGTGGC	GTGCR或GTGTGS	4/12(33.3)
	S26	GTGCGGTGTGCACGGC
	S49	GTGCG---------------TGGC

^a核苷酸序列对应的是标准菌株60190 iceA1的开放读码框和它的上游序列(GenBank登录号: U43917); del代表缺失;

^b标准菌株60190和菌株S26分别代表西方菌株和镇江菌株, 菌株S26和S49分别代表携带不同突变位点的镇江菌株, 下划线部分的核苷酸序列标明的是同向重复序列(其中914del7含重叠部分), Y代表T或者C, R代表G或者A, S代表G或者C.