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世界华人消化杂志. 2012-04-28; 20(12): 1012-1017
在线出版 2012-04-28. doi: 10.11569/wcjd.v20.i12.1012
在线出版 2012-04-28. doi: 10.11569/wcjd.v20.i12.1012
表1 9套全基因组数据集的基本情况
| 类别 | GSE14323 | GSE6764 | GSE9809 | GSE9012 | GSE19004 | GSE2127 | GSE23680 | GSE15251 | GSE8642 |
| 物种 | homo sapiens | homo sapiens | mus musculus | mus musculus | mus musculus | mus musculus | mus musculus | mus musculus | mus musculus |
| 文献 | Mas等[9] | Wurmb-ach等[10] | Liao等[11] | Khetcho-umian等[12] | 仅提供芯片信息 | Sheth等[13] | Li等[14] | 仅提供芯片信息 | 仅提供芯片信息 |
| 芯片 | GPL96, GPL571 | GPL570 | GPL1261 | GPL1261 | GPL1261 | GPL339 | GPL6246 | GPL8308 | GPL339 |
| 实验设计 | unpaired tissues | unpaired tissues | unpaired+paired, tissues | unpaired tissues | unpairedtissues | unpaired+paired tissues | paired, tissues | unpairedtissues | unpaired tissues |
| 探针数 | 22k | 55K | 45k | 45k | 45k | 22k | 48k | 49k | 41k |
| HCC组织 | 47 | 35 | 3 | 5 | 5 | 9 | 4 | 2 | 6 |
| 对照 | 19 | 10 | 7 | 5 | 4 | 6 | 4 | 5 | 9 |
引文著录: 王云, 胡艳玲, 曹骥, 何敏. 生物信息学方法对人类和小鼠共同肝癌相关基因的筛选. 世界华人消化杂志 2012; 20(12): 1012-1017