应用基因芯片技术筛选肝硬化相关基因

表2 肝硬化组织中共同差异表达的部分上调和下调基因

功能分类		GenBank ID	基因名称	基因代码	染色体定位	Signal log Ratio
上调	抗氧化活性相关	NM_006793	peroxiredoxin 3	PRDX3	chr10q25-q26	1.1
		M12523	白蛋白	ALB	chr4q11-q13	2.3
	凋亡或肿瘤相关	NM_004396	DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)box多肽5	DDX5	chr17q21	2.1
		NM_003292	活化MET致癌基因已易位的启动子区	TPR	chr1q25	3.4
		NM_007315	信号传导子及转录激活子1	STAT1	chr2q32.2	2.3
		NM_000245	met原癌基因	MET	chr7q31	1.2
		NM_000596	胰岛素样生长因子结合蛋白1	IGFBP1	chr7p13-p12	6.4
		NM_003299	肿瘤排斥抗原(gp96)1	TRA1	chr12q24.2-q24.3	1.6
		BC002704	信号传导子及转录激活子1, 91 kDa	STAT1	chr2q32.2	2.8
		NM_021960	髓样细胞非白血性白血病序列1	MCL1	chr1q21	1.7
	结合蛋白相关	NM_004539	天冬酰胺酰-tRNA合成酶	NARS	chr18q21.2-q21.3	1.8
		NM_003472	DEK致癌基因	DEK	chr6p23	2.1
		NM_005381	核仁素	NCL	chr2q12-qter	1
		NM_004859	笼形蛋白重肽(Hc)	CLTC	chr17q11-qter	1
		NM_018834	基质蛋白3	MATR3	chr5q31.2	1.6
		NM_002156	热休克蛋白60 kDa 1	HSPD1	chr2q33.1	1.3
		NM_006585	伴侣素封闭物TCP1, 亚单位8	CCT8	chr21q22.11	2.3
		NM_003144	信号序列受体, α	SSR1	chr6p24.3	1.7
	代谢相关	NM_004539	天冬酰胺酰-tRNA合成酶	NARS	chr18q21.2-q21.3	1.8
		NM_004939	DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽1	DDX1	chr2p24	1.4
		NM_005154	泛素特异蛋白酶8	USP8	chr15q21.2	2
		N54448	热应激反应蛋白12	HRSP12	chr8q22	1.4
		NM_004728	DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽21	DDX21	chr10q21	2.1
		NM_001239	细胞周期蛋白H	CCNH	chr5q13.3-q14	1.9
		NM_006910	视网膜母细胞瘤结合蛋白6	RBBP6	chr16p12.2	4.9
		NM_015675	DNA-损伤诱导生长停滞β	GADD45B	chr19p13.3	2
	酶活性调节相关	NM_002734	蛋白激酶, cAMP-依赖调节子I型α	PRKAR1A	chr17q23-q24	2
		NM_002923	G蛋白信号系统调节子2	RGS2	chr1q31	2.4
		NM_000293	磷酸化酶激酶激酶β	PHKB	chr16q12-q13	1.7
		NM_012294	Rap鸟嘌呤核苷酸交换因子5	RAPGEF5	chr7p15.3	2.3
		NM_001735	补体成分5	C5	chr9q33-q34	1.6
		NM_014495	血管生成素-类似物3	ANGPTL3	chr1p31.1-p22.3	2.3
	分子马达相关	BF432550	肌球蛋白IB	MY01B	chr2q12-q34	2
	营养储备相关	NM_005637	染色体18滑膜肉瘤易位	SS18	chr18q11.2	2.5
	分子功能退化相关	NM_012433	剪接因子3b, 亚单位1	SF3B1	chr2q33.1	2.6
		NM_003092	核内小分子核糖核蛋白多肽B	SNRPB2	chr20p12.2-p11.22	1.6
		NM_005872	乳房癌放大序列2	BCAS2	chr1p21-p13.3	1.6
	信号传导相关	NM_000245	met原癌基因	MET	chr7q31	1.2
		NM_007315	信号传导子及转录激活子1	STAT1	chr2q32.2	2.3
		NM_002296	核纤层蛋白B受体	LBR	chr1q42.1	1.5
		NM_001166	颗粒症病毒IAP(基因)重复封闭物2	BIRC2	chr11q22	1.7
		NM_004124	神经胶质成熟因子β	GMFB	chr14q22.2	1.2
		NM_001338	柯萨奇病毒和腺病毒受体	CXADR	chr21q21.1	1.5
		AL096842	线粒体肿瘤抑制基因1	MTUS1	chr8p22	1.1
	结构分子相关	NM_004859	笼形蛋白重肽(Hc)	CLTC	chr17q11-qter	1
		NM_018834	基质蛋白3	MATR3	chr5q31.2	1.6
		NM_000971	核糖体蛋白L7	RPL7	chr8q21.11	1.3
		NM_002291	层粘连蛋白β1	LAMB1	chr7q22	2.5
	转录调控相关	NM_000971	核糖体蛋白L7	RPL7	chr8q21.11	1.3
		NM_014739	BCL2-关联转录因子1	BCLAF1	chr6q22-q23	2
		NM_001964	早期生长应答1	EGR1	chr5q31.1	3
		NM_005935	髓样/淋巴样或混合性白血病易位子2	MLLT2	chr4q21	1.6
		NM_001310	cAMP应答元件结合蛋白-类似物2	CREBL2	chr12p13	1.8
		NM_016614	TRAF和TNF受体相关蛋白	TTRAP	chr6p22.3-p22.1	1.6
	翻译调控相关	NM_014670	基本亮氨酸拉链和W2域1	BZW1	chr2q33	1.7
		NM_001412	性连锁真核·译起始因子1A	EIF1AX	chrXp22.12	1.3
		NM_015904	真核·译起始因子5B	EIF5B	chr2p11.1-q11.1	3.2
		NM_004730	真核·译终止因子1	ETF1	chr5q31.1	2.7
		NM_024863	转录延伸因子A(SII)-类似物4	TCEAL4	chrXq22.2	1.8
		NM_002453	线粒体·译起动因子2	MTIF2	chr2p14-p16	1.8
	物质运输相关	NM_001829	氯化物途径3	CLCN3	chr4q33	1.2
		NM_004896	空泡的蛋白质分选26	VPS26	chr10q21.1	1.3
		NM_003715	小囊泡停靠蛋白质p115	VDP	chr4q21.1	1.8
		NM_002223	肌醇1, 4, 5-三磷酸根受体2型	ITPR2	chr12p11	2
下调	凋亡或肿瘤相关	NM_005022	抑制蛋白1	PFN1	chr17p13.3	-1.9
		NM_002634	阻抑蛋白	PHB	chr17q21	-1.2
		NM_005745	B-cell受体相关蛋白31	BCAP31	chrXq28	-1.1
		NM_004343	钙网织蛋白	CALR	chr19p13.3-p13.2	-1.4
		NM_000358	转化生长因子β	TGFBI	chr5q31	-1.6
		NM_002011	纤维母细胞生长因子受体4	FGFR4	chr5q35.1-qter	-1
		NM_005538	抑制素βC	INHBC	chr12q13.1	-2.7
		NM_018468	早老素增强子2同系物	PSENEN	chr19q13.12	-1.5
	结合蛋白相关	X07868	胰岛素样生长因子Ⅱ	IGFⅡ	chr11p15.5	-1.4
		NM_003752	真核·译起始因子3, 亚单位8	EIF3S8	chr16p11.2	-1.3
		NM_004343	钙网织蛋白	CALR	chr19p13.3-p13.2	-1.4
		NM_001916	细胞色素c-1	CYC1	chr8q24.3	-1.3
		NM_003321	线粒体的Tu·译延伸因子	TUFM	chr16p11.2	-1.2
		NM_005538	抑制素βC	INHBC	chr12q13.1	-2.7
		NM_014868	环指蛋白10	RNF10	chr12q24.31	-1.1
	代谢相关	NM_002065	谷氨酸氨连接酶(谷氨酰胺合酶)	GLUL	chr1q31	-3.5
		NM_001428	烯醇酶1	EN01	chr1p36.3-p36.2	-1.2
		NM_006623	磷酸甘油酸脱氢酶	PHGDH	chr1p12	-1.2
		NM_000075	周期素依赖性蛋白激酶4	CDK4	chr12q14	-1.3
		NM_004390	组织蛋白酶H	CTSH	chr15q24-q25	-1.7
		NM_005035	线粒体的DNA定向RNA多聚酶	POLRMT	chr19p13.3	-1.1
		NM_001069	微管蛋白, β2	TUBB2	chr6p25	-1.3
		NM_000060	生物素化物酶	BTD	chr3p25	-1
	细胞周期相关	NM_002950	(内质网)核糖体结合糖蛋白I	RPN1	chr3q21.3-q25.2	-1.6
		NM_001916	细胞色素c-1	CYC1	chr8q24.3	-1.3
		NM_000244	多发性内分泌腺瘤综合征I	MEN1	chr11q13	-1.2
		NM_001150	膜内氨酰氨基肽酶	ANPEP	chr15q25-q26	-1.2
	酶活性调节相关	NM_001320	酪蛋白激酶2β-多肽	CSNK2B	chr6p21-p12|6p21.3	-1
		NM_004491	糖皮质激素受体DNA结合因子1	GRLF1	chr19q13.3	-1.8
		NM_004127	G蛋白途径抑制子1	GPS1	chr17q25.3	-1.8
		分子马达相关	NM_004082	动力蛋白激活蛋白1	DCTN1	chr2p13
		NM_001614	肌动蛋白γ1	ACTG1	chr17q25	-1
	分子功能退化相关	NM_004343	钙网织蛋白	CALR	chr19p13.3-p13.2	-1.4
	信号传导相关	NM_002840	蛋白酪氨酸磷酸酶受体型F	PTPRF	chr1p34	-1.1
		NM_005745	B-cell 受体相关蛋白31	BCAP31	chrXq28	-1.1
		NM_014748	分选连接蛋白17	SNX17	chr2p23-p22	-2.1
		NM_002205	纤维连接因子受体α多肽	ITGA5	chr12q11-q13	-1.7
		NM_002162	细胞间黏附分子3	ICAM3	chr19p13.3-p13.2	-1.1
		NM_004633	白介素1受体, II型	IL1R2	chr2q12-q22	-1.8
		NM_000024	肾上腺素能的β-2-受体表面	ADRB2	chr5q31-q32	-1
	结构分子相关	NM_001614	肌动蛋白γ1	ACTG1	chr17q25	-1
		NM_004927	线粒体核糖体蛋白L49	MRPL49	chr11q13	-1.3
		NM_002949	线粒体核糖体蛋白蛋白L12	MRPL12	chr17q25	-1
	转录调控相关	NM_001428	烯醇酶1	EN01	chr1p36.3-p36.2	-1.2
		NM_004491	糖皮质激素受体DNA结合因子1	GRLF1	chr19q13.3	-1.8
		NM_003195	转录延伸因子A(SII), 2	TCEA2	chr20q13.33	-2.6
		NM_005693	细胞核受体亚科1, 团H, 成员3	NR1H3	chr11p11.2	-1.3
		NM_000457	肝细胞核因子4, α	HNF4A	chr20q12-q13.1	-2.1
	翻译调控相关	NM_003752	真核翻译起始因子3, 亚单位8	EIF3S8	chr16p11.2	-1.3
		NM_003321	线粒体的Tu·译延伸因子	TUFM	chr16p11.2	-1.2
		NM_004927	线粒体核糖体蛋白L49	MRPL49	chr11q13	-1.3
	物质运输相关	NM_006148	LIM and SH3蛋白1	LASP1	chr17q11-q21.3	-1
		NM_001916	细胞色素c-1	CYC1	chr8q24.3	-1.3
		NM_002631	磷酸葡萄糖酸脱氢酶	PGD	chr1p36.3-p36.13	-1.9
		NM_006623	磷酸甘油酸脱氢酶	PHGDH	chr1p12	-1.2
		NM_006066	乙醛还原酶	AKR1A1	chr1p33-p32	-1.1
		NM_003365	泛醇-细胞色素C还原酶核心蛋白I	UQCRC1	chr3p21.3	-1.4